河南漢族群體14個Y-STR基因座單倍型遺傳多態(tài)性研究.pdf

1、研究背景及目的:
　　 短串聯重復序列(short tandem repeats,STR)又稱衛(wèi)星DNA,廣泛分布于人類基因組中,由于其具有較高的遺傳多態(tài)性,易于分型檢測,目前已成為法醫(yī)物證鑒定等方面的主要檢測對象。尤其Y染色體短串聯重復序列(Y-shorttandem:repeat,Y-STR)基因座具有精確的父系單倍體連鎖遺傳,以及多態(tài)性信息含量高、擴增片段小,檢測靈敏度高,分型簡便,易于推廣應用等特點,在父系男性成員間進行

2、親權鑒定等特殊情況下,表現出常染色體STR不可替代的優(yōu)點。文獻已報道的Y-STR基因座較多,但單個Y-STR位點的信息含量有限,為尋求高多態(tài)性的單倍型復合體系、提高個體識別力、節(jié)約檢材和提高工作效率,應繼續(xù)尋求新的高多態(tài)性的Y-STR位點并構建復合體系,研究其群體或種族的分布頻率,以豐富人類基因組數據庫,為法醫(yī)物證學鑒定提供可靠的技術及數據支持。
　　 Y-STR具有明顯的民族和地域差異,為獲得河南漢族群體中具有較高多態(tài)性和個體

3、識別力的Y-STR單倍型,本實驗首次調查DYS713、DYS720和DYS635多態(tài)性位點在河南漢族群體中的遺傳學數據,并結合優(yōu)選的DYS456、DYS389Ⅰ、DYS390、DYS389Ⅱ、H4、A7.1、DYS391、DYS448、DYS393、DYS439、DYS392等11個多態(tài)性較高的Y-STR位點,自行設計構建4個復合擴增體系進行檢測分析,調查研究這14個Y-STR基因座在河南漢族群體中的基因多樣性(genediversit

4、y,GD)和單倍型多樣性(haplotype diversity,HD),為Y-STR在法醫(yī)學個體識別和遺傳學親權鑒定、人類遺傳學等方面的應用奠定基礎。
　　 實驗方法:
　　 實驗組共203名河南漢族健康無關男性個體靜脈血液樣本,酚-氯仿法抽提全血基因組DNA；對選取的14個Y-STR多態(tài)性位點分4組優(yōu)化構建復合擴增體系(編號Ⅰ～Ⅳ)；擴增產物進行變性聚丙烯酰胺凝膠垂直電泳并銀染顯色；對電泳結果進行判讀并自行制備等位基

5、因分型標準品,經測序驗證后對各等位基因進行命名。最后計算獲取這些Y-STR位點在河南漢族群體中的基因多樣性(GD)及單倍型多樣性(HD)。
　　 此外,本文選取20對真父子、20對非父子(均經常染色體STR檢測確定)及50例女性為對照,進行4個復合擴增體系的驗證分析。
　　 結果：
　　 1.DYS713、DYS720和DYS635基因座分別檢出8、10、9個等位基因,個體識別能力(DP)分別為0.7298、0.

6、7778和0.8049,基因多樣性(GD)分別為0.7334、0.7663、0.8089:
　　 2.在203名無關檢測個體中,14個Y-STR多念性基因座所組成的單倍型有203種,單倍型多樣性(HD)為1,個體識別力(DP)達0.999976。
　　 結論：
　　 1.DYS713、DYS720、DYS635基因座在河南漢族群體中具有較高的多態(tài)信息含量和高鑒別力,滿足法醫(yī)學對STR基因座的選擇要求: