陜南漢族15個(gè)常染色體STR基因座及10個(gè)Y-STR基因多樣性研究.pdf

1、目的：分析15個(gè)常染色體短串聯(lián)重復(fù)序列（Autosomal Short Tandem Repeat）和10個(gè)Y染色體短串聯(lián)重復(fù)序列（Y-chromosomal Short Tandem Repeat， Y-STR）基因座及其單倍型在陜南漢族人群的基因多樣性分布，豐富中華民族STR遺傳信息資源，并基于已發(fā)表的族群遺傳數(shù)據(jù)，探討了陜南漢族和其他民族群體之間的遺傳關(guān)系，并為法醫(yī)學(xué)及其相關(guān)研究提供依據(jù)。
　　方法：采用Expressmar

2、ker16+10Y（EX16+10Y）熒光檢測(cè)體系，對(duì)陜南漢族214個(gè)健康、無(wú)關(guān)個(gè)體的15個(gè)常染色體STR基因座、Amelogenin和10個(gè)Y染色體STR基因座進(jìn)行多重復(fù)合擴(kuò)增，用ABIPRISM3130遺傳分析儀對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)分型。從數(shù)據(jù)庫(kù)中下載其他17個(gè)民族的15個(gè)常染色體STR和17個(gè)Y-Filer（AmpFISTR Y-FilerTM）基因座的分型數(shù)據(jù)，結(jié)合本研究中陜南漢族的數(shù)據(jù)，利用軟件ARLEQUIN進(jìn)行分子方差

3、分析，利用軟件DISPAN計(jì)算遺傳距離DA，利用軟件MEGA和PHYLIP分別進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹分析，利用軟件MVSP進(jìn)行主成分分析。
　　結(jié)果：研究獲得陜南漢族15個(gè)常染色體STR和10個(gè)Y-STR基因座的分型數(shù)據(jù)，15個(gè)常染色體STR基因座在214個(gè)無(wú)關(guān)個(gè)體中發(fā)現(xiàn)150個(gè)等位基因，等位基因頻率分布在0.0023-0.5210，累計(jì)個(gè)體識(shí)別率和非父排除率分別為0.999999999999999998869和0.999998491。陜

4、南漢族108個(gè)男性個(gè)體中，共發(fā)現(xiàn)100種單倍型，其中僅出現(xiàn)一次的Y-STR單倍型94個(gè)，Y-STR單倍型多樣性為0.9983。Y-STR基因座除了DYS391和DYS438以外，其余8個(gè)基因座的遺傳多樣性值（Gene Diversity，GD）均在0.5以上，具有高度遺傳多樣性。對(duì)陜南漢族和其他17個(gè)群體的遺傳關(guān)系研究顯示，陜南漢族和華東漢族在25個(gè)STR基因座的等位基因頻率分布上均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，表現(xiàn)出相對(duì)較近的群體遺傳關(guān)系；然而陜南漢