12個STR基因座在四個品種犬中的遺傳多樣性分析及其在個體識別中的應(yīng)用.pdf

1、本試驗挑選12個位于犬不同染色體上的STR基因座位點，，對拉布拉多犬、史賓格犬、德國牧羊犬和藏獒四個品種的群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性進行分析，并探索其在犬只個體身份識別中的應(yīng)用，旨在：（1）了解這四個品種犬的遺傳多樣性，為犬品種資源的保存和開發(fā)利用提供理論依據(jù)；（2）應(yīng)用熒光標記復合擴增技術(shù)對犬只個體身份進行鑒定，為進一步開發(fā)國產(chǎn)犬個體識別試劑盒奠定基礎(chǔ)，建立便捷、快速、標準的犬DNA檢測方法，促進我國工作犬DNA數(shù)據(jù)庫的建立；（3）豐富

2、完善中國工作犬DNA數(shù)據(jù)庫，為公安刑事偵查和維護受害者權(quán)益提供技術(shù)支持。
　　 本文第-部分試驗所用樣本來自四個品種的工作犬，共244個樣本（拉布拉多犬72頭，史賓格犬49頭，德國牧羊犬52頭，藏獒71頭）；第二部分試驗樣本來自送檢的檢材，-只攻擊人的中型犬的毛囊樣本和血液樣本，以及帶有唾液斑痕的布料。本文主要研究內(nèi)容分別為下列兩個方面：
　　 1.12個STR基因座在四個品種犬群中的遺傳多樣性分析
　　 應(yīng)用F

3、HC2010、FHC2054、FHC2087、FHC2132、FHC2137、FHC2302、FHC2328、FHC2412、FHC2611、PEZ2，PEZ20和PEZ3等12個STR基因座組成熒光標記復合體系，研究在拉布拉多犬、史賓格犬、德國牧羊犬和藏獒中的多態(tài)信息含量（PIC）、期望雜合度（H（e））、觀察雜合度（H（o））和有效等位基因（ne），分析這四個品種的遺傳距離、系統(tǒng)聚類分析及F-統(tǒng)計量，并對這12個STR基因座的法醫(yī)學

4、應(yīng)用指標進行了統(tǒng)計分析，研究結(jié)果如下：
　　 （1）構(gòu)建的12個STR基因座熒光標記復合擴增體系擴增效果良好，無非特異性擴增現(xiàn)象，絕大部分樣本擴增結(jié)果均一，產(chǎn)物峰值基本集中在1500-2000RFU，同色各STR基因座間無重疊。
　　 （2）在12個STR位點中，共檢測到211個等位基因，基因頻率分布在0.007～0.590，平均每個STR基因座等位基因數(shù)為18.58個，表明所選取的12個微衛(wèi)星位點在這四個品種犬群中多態(tài)

5、性很豐富。
　　 （3）4個品種犬群體在不同STR基因座的多態(tài)信息含量（PIC）都較高，都在0.5以上，均為高度多態(tài)性位點。拉布拉多、史賓格、德牧和藏獒的12個STR基因座的平均多態(tài)信息含量為分別為0.763、0.768、0.728和0.847，平均雜合度分別為0.844、0.802、0.720和0.851，這表明4個品種犬群均具有豐富的遺傳多樣性，可以用來分析群體的遺傳結(jié)構(gòu)。
　　 （4）4個品種犬群的總?cè)后w近交系數(shù)（

6、Fit）為0.0680，群體內(nèi)近交系數(shù)（Fis）為-0.0054，群體間基因分化系數(shù)（Fst）為0.073，說明四個品種犬群體間7.3％的遺傳變異來自群體間，而92.7％的遺傳變異是由各群體內(nèi)個體間的差異引起的；基因流Nm平均值為3.1739。
　　 （5）經(jīng)遺傳距離分析，德國牧羊犬與拉布拉多犬的遺傳距離最遠（0.9171），而兩者之間的遺傳一致性最?。?.3997）；藏獒與史賓格犬的遺傳距離最近（0.3289），而兩者之間的遺

7、傳一致性最高（0.7197）。兩種聚類分析結(jié)果均表明，德國牧羊犬為外群，從聚類進化樹上分析可知，德國牧羊犬單獨聚為一類，拉布拉多與藏獒相聚為一類再與史賓格犬聚為一類，聚類結(jié)果與品種育成史基本一致。
　　 （6）法醫(yī)學分析表明12個STR基因座的平均雜合度是0.811，平均多態(tài)信息含量是0.777，累積匹配率（TPm）、累積個體識別力（TDp）和累積排除率（CPE）在四個犬群中結(jié)果如下：拉布拉多犬中分別為3.56 x10-3、0.

8、9999999999996和0.99999999565；史賓格犬中分別為1.83×10-13、0.9999999999998和0.99999803150；德國牧羊犬中分別為1.33×10-11、0.9999999999867和0.99981801953；藏獒中分別為3.29×10-16、1.00000000000和0.99999995452。
　　 2.應(yīng)用12個STR基因座對咬人嫌疑犬只身份進行個體識別應(yīng)用包括FHC2132、

9、FHC2302、PEZ3、PEZ2、FHC2010、FHC2137、FHC2412、FHC2611和PEZ20等12個STR基因座的建立的熒光復合擴增體系，對收到的檢材：被攻擊者褲子上的唾液斑痕、肇事犬只毛囊樣本，以及嫌疑犬只的血液樣本進行DNA檢測。經(jīng)DNA圖譜比對，嫌疑犬只的血液樣本DNA與現(xiàn)場提取到的毛發(fā)、唾液斑痕擴增的DNA圖譜幾乎完全一致，其偶合概率（PM）為4.2×10-19，似然比率（LR）為2.38×1018，可以認定該