人類miRNA調(diào)控因子及靶基因的基因本體分析.pdf

1、MicroRNA(miRNA)是一類約22nt的內(nèi)源性小分子RNA,主要通過與其靶基因mRNA的3’UTR區(qū)互補(bǔ)結(jié)合使之降解或影響mRNA的翻譯,實(shí)現(xiàn)了對基因的轉(zhuǎn)錄后沉默[1]。miRNA通過作用于多個(gè)靶基因在很多信號通路,如發(fā)育、分化、增殖、細(xì)胞凋亡中發(fā)揮重要作用[2]。同時(shí),其自身表達(dá)還受到前體轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控,在人類正常組織和腫瘤細(xì)胞系中均存在組織特異性的表達(dá)模式[3-4]。從而組成miRNA上下游,復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)回路。
　　

2、 本研究利用基因本體(Gene Ontology,GO)數(shù)據(jù)庫[5]和GOmir工具[6],分別對382個(gè)miRNA的上游轉(zhuǎn)錄因子和下游靶基因參與的生物學(xué)過程,行使分子功能和細(xì)胞組分構(gòu)成三個(gè)方面做聚類分析。分析結(jié)果顯示,miRNA的“轉(zhuǎn)錄因子/轉(zhuǎn)錄因子”和“靶基因/靶基因”之間,存在著廣泛的正、負(fù)相關(guān)關(guān)系,提示它們之間可能存在協(xié)同或拮抗作用。特別地,我們還發(fā)現(xiàn)一類“轉(zhuǎn)錄因子/靶基因”之間的相關(guān)性,提示轉(zhuǎn)錄因子可能通過miRNA,影響相關(guān)