基于線粒體序列變異探討野豬系統(tǒng)地理學(xué)及家豬起源.pdf

1、野豬(Susscrofa)是家豬的祖先，廣泛棲息于亞洲、歐洲及非洲北部。該文首先對系統(tǒng)地理學(xué)研究進(jìn)展進(jìn)行了綜述，然后分別基于線粒體控制區(qū)(D-loop)序列、細(xì)胞色素b(cytb)基因的遺傳變異分析，探討野豬的系統(tǒng)地理演化過程，并基于cytb序列變異探討了家豬的起源。具體包括以下幾個部分： 1、綜述介紹了更新世時期全球環(huán)境周期性變化以及中國在更新世時期自然景觀的變化，概述了系統(tǒng)地理學(xué)研究的基本理論及研究進(jìn)展。 2、研究測

2、定了中國東北、華北及四川西部野豬72個個體線粒體控制區(qū)全序列，結(jié)合GenBank報道的日本野豬(S.s.leucomystax)、琉球野豬(S.s.riukiuanus)72個控制區(qū)全序列，分析了東北亞地區(qū)野豬的線粒體DNA變異及系統(tǒng)地理格局。結(jié)果發(fā)現(xiàn)：(1)東北亞地區(qū)野豬控制區(qū)共有34個單元型，含42個變異位點。(2)東北亞地區(qū)野豬具有同一祖先，現(xiàn)生種群具有顯著的種群遺傳結(jié)構(gòu)。(3)日本野豬與分布于中國東北野豬(S.s.ussuric

3、us)間的親緣關(guān)系較近，而琉球野豬與華北野豬(S.s.moupinensis)間親緣關(guān)系較近。(4)巢式進(jìn)化枝地理距離分析表明東北亞地區(qū)野豬由同一祖先經(jīng)過長距離的遷徙而形成現(xiàn)生各種群(或亞種)。 3、測定了中國東北、華北、華南及新疆、云南72頭野豬的線粒體cytb基因序列，并結(jié)合前人發(fā)表的資料，通過對238頭野豬cytb序列變異分析，探討了野豬種群遺傳結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系，分析其系統(tǒng)地理格局形成過程。研究表明：(1)238個序列發(fā)

4、現(xiàn)變異位點128個，含74種單元型；(2)東北野豬與華南野豬親緣關(guān)系很近，東北野豬可能是近期由華南野豬向北經(jīng)長距離擴(kuò)張而形成；(3)朝鮮野豬(S.s.coreanus)并非東北野豬與日本野豬之間的過渡種群，朝鮮半島可能并非大陸野豬遷入日本的通道。 (4)在冰期亞平寧半島為歐洲野豬的一個避難所，但冰期后該地區(qū)野豬并沒有能通過阿爾卑斯山脈向歐洲大陸擴(kuò)張；歐洲大陸野豬(S.s.scrofa)可能是南部小亞細(xì)亞或巴爾干半島的種群向北擴(kuò)張

5、形成。 4、研究對歐亞大陸的238頭野豬和31個家豬品種的102頭家豬的cytb序列變異分析，探討了家豬與不同野豬亞種間的關(guān)系，討論了亞洲家豬與歐洲家豬的起源。在家豬和野豬cytb序列所有的序列中，共發(fā)現(xiàn)156個變異位點，定義了108種單元型。分析表明：(1)歐洲家豬和亞洲家豬經(jīng)長時間彼此獨立的馴化而形成，在歐洲家豬品種形成中已有亞洲家豬基因滲透；(2)歐洲大陸野豬是歐洲大多數(shù)家豬品種的直接祖先；(3)亞洲家豬具有同一馴化中心，