牦牛IGF-I基因及IGF-IR基因多態(tài)性與生長發(fā)育性狀關(guān)系的研究.pdf

1、將IGF-I基因和IGF-IR基因作為控制生長發(fā)育性狀主基因的候選基因，采用PCR-SSCP技術(shù)對高原地區(qū)五個不同地方牦牛品種(類群)共404個個體(大通牦牛、青海高原牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛、新疆牦牛)的IGF-I基因和IGF-IR基因的多態(tài)性進行了檢測，對具有SSCP多態(tài)性的片段進行克隆和測序找出等位基因的多態(tài)位點，分析了不同基因型與大通牦牛生長性狀的關(guān)系，以期從分子水平上為牦牛育種提供理論依據(jù)。并對大通牦牛、甘南牦牛、天祝白牦牛

2、的體尺指標(biāo)進行了比較，研究結(jié)果及結(jié)論如下： (1)首次在牦牛IGF-I基因的第1內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)PCR-SSCP多態(tài)，結(jié)果表明：該多態(tài)位點由一對等位基因A、B控制，進行序列比對發(fā)現(xiàn)一處單堿基C的缺失/插入，造成了該多態(tài)位點的出現(xiàn)。等位基因A(B)在大通牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛、青海高原牦牛、新疆牦牛群體中的基因頻率分別為0.9028(0.0972)、0.9234(0.0766)、0.8485(0.1515)、0.7929(0.207

3、1)、0.9200(0.0800)，等位基因A為五個群體中的優(yōu)勢等位基因。 (2)IGF-I基因第5外顯子的PCR-SSCP分析結(jié)果表明：品種間基因型分布存在顯著差異，在大通牦牛中檢測到了AA、BB和AB 3種基因型，而在其它群體中只檢測到AA型，未檢測到AB型和BB型的分布，在該基因位點達(dá)到了純合狀態(tài)。經(jīng)克隆測序表明：該位點的多態(tài)是由于T→C的突變導(dǎo)致等位基因A突變成等位基因B。 (3)IGF-IR基因的PCR-SSC

4、P結(jié)果分析顯示該位點的多態(tài)是由于一處堿基C→G的突變引起的，等位基因A(B)在大通牦牛，天祝白牦牛、甘南牦牛、青海高原牦牛、新疆牦牛的基因頻率分別為：0.6458(0.3542)、0.6802(0.3198)、0.7475(0.2525)、0.5571(0.4429)、0.6100(0.3900)。在此位點所有的群體都處于平衡狀態(tài)。 (4)對多態(tài)位點基因型分布進行卡方檢驗，發(fā)現(xiàn)新疆牦牛在位點IGF-IR-P6處于非平衡狀態(tài)(P<

5、0.01)并發(fā)現(xiàn)多態(tài)位點不存在品種分布差異。對多態(tài)位點的純合度、雜合度、有效等位基因數(shù)以及多態(tài)信息含量進行統(tǒng)計分析，結(jié)果表明：IGF-I-P2位點，青海高原牦牛的PIC屬于中度多態(tài)，大通牦牛、天祝白牦牛、甘南牦牛、新疆牦牛的PIC屬于低度多態(tài)。IGF-I-P5位點，大通牦牛在該位點的PIC屬于中度多態(tài)，而天祝白牦牛，甘南牦牛，青海高原牦牛，新疆牦牛在該位點達(dá)到純合狀態(tài)；IGF-IR-P6位點的PIC，純合度、雜合度、Ne在五個牦牛群體中

6、基本相似，PIC屬于中度多態(tài)，位點雜合度也較高。 (5)在大通牦牛群體內(nèi)，分析了IGF-I和IGF-IR基因3個多態(tài)位點不同基因型與大通牦牛6月齡、12月齡、18月齡體尺性狀的關(guān)系，結(jié)果顯示：IGF-I-P2位點上AA型與6月齡的體重和體斜長存在顯著正相關(guān)；IGF-I-P2、IGF-IR-P6位點上AA基因?qū)?2月齡體重有顯著影響；IGF-IR-P6位點AA基因型對體重和體長有顯著增加；IGF-IR-P6位點的AA基因型對18月