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文檔簡介
1、本文研究目的:采用抑制性消減雜交技術(SSH)從短間隔連續(xù)部分肝切除(SISPH)文庫中發(fā)現(xiàn)諸多可能代表肝再生中差異表達的基因的ESTs片斷,生物信息學分析表明一個EST與人和小鼠hsbp1cDNA序列有很高的相似性,研究該基因的結構和功能。 研究方法:以hsbp1基因的EST為依據(jù)合成探針,用Southern方法從再生肝全長cDNA文庫中篩選目的基因;用電子克隆進行基因的染色體定位;用Genscan分析基因的結構;用Nucleo
2、tide-nucleotideBLAST(NCBI)進行基因的同源性分析;用EXPASYMolecularBiologyServer進行蛋白質的高級結構和修飾加工預測;將cDNA的ORF區(qū)與pGEX-2TK連接構建原核表達載體;用IPTG誘導融合蛋白表達;用GlutathioneSepharose4B親和層析方法純化融合蛋白;用純化蛋白免疫家兔,制備多克隆抗體;用基因表達譜芯片、RT-PCR、原位雜交分析肝再生中mRNA的含量變化動態(tài);
3、用原位雜交分析胚胎中的HSBP1分布和含量。 研究結果:克隆的hsbp1cDNA全長為1147bp,并獲得GeneBank登陸號AF522937;hsbp1位于大鼠染色體19q12,由6個外顯子和7個內含子組成,其ORF含有228bp,起始密碼子ATG位于36~38核苷酸處,終止密碼子TGA位于264~266核苷酸處,編碼76個氨基酸;HSBP1廣泛存在血液、骨骼、大腦、眼睛、心臟、腎臟、肝臟、肺、肌肉、皮膚、胰腺、外周神經(jīng)、軟組
4、織、胃、舌、子宮中,且在進化中高度保守;HSBP1蛋白可能形成卷曲螺旋結構,沒有正向或反向的跨膜區(qū)域,有2個絲氨酸磷酸化位點;表達和純化的GST-HSBP1融合蛋白分子量為8kD;HSBP1mRNA的含量高峰出現(xiàn)在6h和144h的再生肝中和第八天大鼠原腸胚中。 研究結論:hsbp1位于大鼠染色體的19q12,由7個內含子和6個外顯子組成;HSBP1在進化中非常保守;HSBP1廣泛存在血液、骨骼、大腦、眼睛、心臟、腎臟、肝臟、肺、肌
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