蛋白質二級結構中的簡化編碼技術.pdf

1、生物信息學是用計算機來處理和研究生物信息的一門新興學科.其中,蛋白質二級結構預測一直是生物信息學中的一個基本問題.如何獲得結果更準確,時間空間效率最高的預測方法是生物信息學研究工作者的一個重要課題.蛋白質結構的預測一直在生物信息學中占有重要的地位.論文首先用一些篇幅簡要介紹了一下生物信息學的基本內(nèi)容和一些問題,接著用概要的語言闡述了生物信息學和生物實驗的研究方法和重大意義;最后介紹了蛋白質二級結構的預測和空間結構的預測的主要進展和方法,

2、以及一些最新的研究成果.接著文章轉入理論內(nèi)容,主要介紹了神經(jīng)網(wǎng)絡建模預測蛋白質二級結構的理論.更重要的是介紹了如何從一般概率體系出發(fā),更好的理解神經(jīng)網(wǎng)絡這個經(jīng)常被視為與概率理論不相關的方法,這種思想將用來指導神經(jīng)網(wǎng)絡結構設計以及機器學習中代價函數(shù)的選擇.在最后,考慮神經(jīng)網(wǎng)絡用于蛋白質二級結構預測時,通常采用正交編碼.考慮到不同蛋白質間的物理化學性質,由此提出了一種新的簡化的編碼技術,并與其它蛋白質二級結構預測的方法進行了比較,通過數(shù)值計