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文檔簡介
1、背景:冠心病(coronary artery disease,CAD)指冠狀動脈粥樣硬化使血管腔狹窄或阻塞,和(或)因冠狀動脈功能性改變(痙攣)導(dǎo)致心肌缺血缺氧或壞死而引起的心臟病,亦稱缺血性心臟病,是目前世界范圍內(nèi)主要致死性疾病之一。在中國,急性冠脈綜合征的發(fā)病率逐年上升,因急性冠脈綜合征死亡的人數(shù)逐年遞增。近年來,全基因組相關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association study,GWAS)揭示出越來越多的基因多態(tài)性(S
2、NP)與CAD(包括ACS)發(fā)病風(fēng)險密切相關(guān)。人類基因組序列中約有5%-10%的序列被穩(wěn)定轉(zhuǎn)錄,除約1%的序列為蛋白質(zhì)編碼基因外,絕大部分為non-codingRNAs(ncRNAs)。根據(jù)ncRNAs的長度,可分為轉(zhuǎn)錄起始RNA(tiRNA)、Piwi蛋白相互作用RNA(piRNA)、微小RNA(microRNA)、小核仁RNA(snoRNA)和長鏈非編碼RNA(lncRNA,>200nt)等。長鏈非編碼RNA(long non-co
3、ding RNA,lncRNA)是非編碼RNA家族的重要成員之一,是目前生命科學(xué)研究領(lǐng)域中的熱點。盡管lncRNA通常不直接參與編碼蛋白,但其卻可以在細(xì)胞生命活動過程中發(fā)揮重要的調(diào)控功能。H19基因?qū)儆趌ncRNA家族的重要成員之一,其廣泛參與了各種病理生理過程的調(diào)控。有研究表明H19基因參與了冠心病的動脈粥樣硬化的發(fā)生發(fā)展過程,其中rs217727和rs2067051兩個多態(tài)位點已經(jīng)證實與冠心病的發(fā)病風(fēng)險存在密切關(guān)系,故我們擬采用病例
4、-對照研究,選擇H19目前研究最熱的3個基因多態(tài),研究其與急性冠脈綜合征的關(guān)系,以揭示H19基因多態(tài)性與ACS發(fā)病風(fēng)險及相關(guān)危險因素和臨床特征的相關(guān)分析之間的關(guān)系。
目的:本文旨在探討長鏈非編碼RNA H19基因rs2735971、rs2839698、rs3024270三個SNPs與急性冠脈綜合征發(fā)病風(fēng)險之間的關(guān)系以及相關(guān)危險因素和臨床特征中的預(yù)警作用。
研究方法:本研究收集了遼寧省漢族人群包括ACS患者(共209名
5、)及與其同期年齡、性別匹配的對照人群(共186名)。應(yīng)用KASPar的方法檢測rs2735971、rs2839698、rs3024270進(jìn)行基因分型,同時對比病例組和對照組兩組之間性別、年齡、以及基因分布情況;采用多重回歸模型及計算基因單倍體分析基因多態(tài)位點與ACS的發(fā)病風(fēng)險;通過Logistic回歸、MDR軟件分析基因多態(tài)性位點與ACS的基因間基因交互作用。SNP間交互作用應(yīng)用多重回歸模型進(jìn)行評估,并對年齡、性別因素進(jìn)行校正。在進(jìn)行臨
6、床特征與基因多態(tài)關(guān)系的分析時,首先選取基因多態(tài)致病的主要作用模型,當(dāng)顯性模型對于疾病貢獻(xiàn)的P值小于隱性模型時,則選用顯性模型分組進(jìn)行與臨床特征關(guān)系的分析,反之則選用隱性模型。P<0.05認(rèn)為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
結(jié)果:我們發(fā)現(xiàn)H19 rs2735971多態(tài)GA雜合子與GG野生基因型相比,罹患急性冠脈綜合征的發(fā)病風(fēng)險降低到0.50倍(P=0.003,95%CI=0.32-0.80)。該多態(tài)的隱性模型和等位基因模型同樣發(fā)病風(fēng)險降低
7、到0.52或0.61倍(分別為P=0.004,95%CI=0.33-0.81或P=0.011,95%CI=0.41-0.89)。這種效應(yīng)在女性、非吸煙者、非飲酒者亞組中更明顯(分別為OR=0.29; OR=0.44heOR=0.40)。在H19 rs2839698多態(tài)CT+TT基因型存在的條件下,H19 rs2735971顯性模型存在上位效應(yīng),罹患急性冠脈綜合征的發(fā)病風(fēng)險降低更為顯著(OR=0.36)。而H19的rs2839698和rs
8、3024270多態(tài)與急性冠脈綜合征的發(fā)病風(fēng)險未見明顯相關(guān)性(P>0.05),但H19 rs2839698多態(tài)在老年人亞組中顯性模型提高了罹患急性冠脈綜合征的發(fā)病風(fēng)險。H19 rs3024270多態(tài)在男性和非吸煙者亞組降低了罹患冠脈綜合征的發(fā)病風(fēng)險。在單體型分析中,H19 rs2735971-rs2839698-rs3024270多態(tài)A-C-C單體型降低了罹患急性冠脈綜合征的發(fā)病風(fēng)險到0.55倍(P=0.010,95%CI=0.35-0.
9、87)。采用多因素Logistic回歸分析,發(fā)現(xiàn)三種多態(tài)與宿主環(huán)境因素吸煙飲酒未見交互作用。但采用MDR分析,發(fā)現(xiàn)H19rs2735971-吸煙-飲酒構(gòu)成的三因子預(yù)測模型可以提示急性冠脈綜合征的發(fā)病風(fēng)險,但該預(yù)測模型在積累效應(yīng)中未得到驗證。在進(jìn)行相關(guān)危險因素分析時,H19rs2735971和rs2839698多態(tài)選用顯性模型進(jìn)行分析,而rs3024270多態(tài)選用隱性模型。我們發(fā)現(xiàn),H19 rs2735971多態(tài)變異型GA+AA基因型與野
10、生型相比,甘油三酯含量正常者居多,即含量過高者居少(P=0.039),且定量分析結(jié)果顯示,該多態(tài)變異型者甘油三酯含量的均值低于野生型者(1.76±1.25 vs.2.69±2.77,P=0.044)。H19rs3024270多態(tài)CC變異基因型與GG+GC基因型相比,低密度脂蛋白的含量普遍降低(2.36±1.00 vs.2.98±1.01,P=0.005)。而這三種多態(tài)對冠脈病變嚴(yán)重程度未見相關(guān)性。
結(jié)論:H19基因多態(tài)性(rs
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