miRNAs、MTHFR基因多態(tài)性與中國漢族人群缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文對miRNAs、MTHFR基因多態(tài)性與中國漢族人群缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)性進行了研究。本研究分為兩個部分:
  第一部分:miRNAs、MTHFR基因多態(tài)性與中國漢族人群缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)研究。
  目的:缺血性腦卒中(Ischemic stroke,IS)是一類由基因和環(huán)境因素共同作用而導(dǎo)致的復(fù)雜性疾病。MicroRNAs(miRNAs)和亞甲基四氫葉酸還原酶(methylenetetrahydro-folate redu

2、ctase,MTHFR)在缺血性腦卒中的發(fā)生和發(fā)展中起到重要作用。MicroRNAs和MTHFR基因單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)與人類很多疾病易感性有關(guān)。近年的研究表明,miR-146a C>G(rs2910164)、miR-196a2 T>C(rs11614913)、miR-499 A>G(rs3746444)和miR-149T>C(rs2292832)已經(jīng)被發(fā)現(xiàn)與多種疾病

3、發(fā)病易感性有關(guān);然而,它們對缺血性腦卒中發(fā)病易感性影響的研究報道很少,與亞型關(guān)聯(lián)研究更少,且結(jié)果不一。MTHFR3’-非翻譯區(qū)(3’-untranslated region,3’-UTR)SNPs能夠改變基因表達,影響與miRNAs結(jié)合,增加疾病發(fā)生風(fēng)險,而其3’-UTR(rs4846049) G>T多態(tài)性與缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)及其與miRNAs基因-基因交互作用,目前尚未檢索到相關(guān)報道。本研究探討miRNAs、MTHFR基因多態(tài)性與中國

4、漢族人群缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)性。
  方法:本研究采用病例-對照設(shè)計,隨機選取符合研究標準的396名缺血性腦卒中病人為病例組,對照組為378名健康人群。按照TOAST分型標準分為:大動脈粥樣硬化型(1arge artery atherosclerosis,LAA)和小動脈閉塞型(small artery occlusion,SAO),進行亞組分析。采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(Polymerase chain reacti

5、on-Restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)和直接測序法對miR-146a C>G(rs2910164)、miR-196a2 T>C(rs11614913)、miR-499A>G(rs3746444)、miR-149T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)五個SNPs在病例組及對照組進行基因分型分析。采用擬合優(yōu)度卡方檢驗分析Hardy-Weinbe

6、rg遺傳平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE);采用logistic回歸模型分析SNPS及其與傳統(tǒng)危險因素(吸煙、飲酒、糖尿病、高血壓?。┙换プ饔脤θ毖阅X卒中的影響;采用多因子降維法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析基因-基因交互作用對缺血性腦卒中的影響;采用廣義線性模型分析與缺血性腦卒中相關(guān)SNPs對血脂的影響。
  結(jié)果:⑴所有研究對象每個S

7、NP位點基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),表示所選取樣本具有人群代表性,適合行遺傳學(xué)分析。⑵miR-146 a C>G(rs2910164) GG基因型可顯著增加缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(OR=1.86,95% CI:1.19-2.88,P=0.006);顯性模型示:CG+GG基因型較CC基因型可增加39%的發(fā)病風(fēng)險(OR=1.39,95% CI:1.04-1.86,P=0.027);隱性模型示:GG基因型較

8、CC+CG基因型可增加62%的發(fā)病風(fēng)險(OR=1.62,95% CI:1.08-2.42,P=0.020);加性模型示:每增加1個G等位基因,其發(fā)病風(fēng)險增加34%(OR=1.34,95% CI:1.09-1.65,P=0.006);與C等位基因相比,G等位基因可顯著增加缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(OR=1.33,95% CI:1.09-1.64,P=0.006)。亞組分析示,rs2910164 C>G可顯著增加LAA型發(fā)病風(fēng)險(P<0.05)

9、,僅在校正傳統(tǒng)危險因素后,GG基因型可增加SAO型發(fā)病風(fēng)險(P<0.05)。⑶miR-149 T>C(rs2292832)CC基因型可顯著增加缺血性腦卒中的發(fā)病風(fēng)險(OR=2.00,95% CI:1.22-3.28,P=0.006);顯性模型示:TC+CC基因型較TT基因型可顯著增加42%的發(fā)病風(fēng)險(OR=1.42,95% CI:1.07-1.88,P=0.017);隱性模型示:CC基因型較TT+TC基因型可增加75%的發(fā)病風(fēng)險(OR=

10、1.75,95% CI:1.09-2.82,P=0.020);加性模型示:每增加1個C等位基因,其發(fā)病風(fēng)險增加37%(OR=1.37,95% CI:1.11-1.7,P=0.004);與T等位基因相比,C等位基因可顯著增加缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(OR=1.37,95% CI:1.11-1.7,P=0.004)。亞組分析示,rs2292832 T>C可顯著增加LAA型發(fā)病風(fēng)險(P<0.05),未發(fā)現(xiàn)與SAO型發(fā)病風(fēng)險顯著相關(guān)性(P>0.05

11、)。⑷MTHFR G>T(rs4846049)TT基因型可顯著增加缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(OR=2.87,95% CI:1.43-5.76,P=0.003);顯性模型示:GT+TT基因型攜帶者發(fā)病風(fēng)險是GG基因型的1.71倍(OR=1.71,95% CI:1.28-2.28,P<0.001);隱性模型示:TT基因型攜帶者發(fā)病風(fēng)險是GG+GT基因型的2.41倍(OR=2.41,95% CI:1.21-4.8,P=0.012);加性模型示:每

12、增加一個T等位基因,其發(fā)病風(fēng)險增加63%(OR=1.63,95% CI:1.28-2.08,P<0.001);與G等位基因相比,T等位基因可顯著其發(fā)病風(fēng)險(OR=1.62,95% CI:1.28-2.06,P<0.001)。亞組分析示,rs4846049 G>T可顯著增加LAA型發(fā)病風(fēng)險(P<0.05);也可增加SAO型發(fā)病風(fēng)險(P<0.05),但校正傳統(tǒng)危險因素后,未達到顯著統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。⑸未發(fā)現(xiàn)miR-196a2 T>

13、C(rs11614913)和miR-499 A>G(rs3746444)多態(tài)性與缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險有顯著相關(guān)性(P>0.05);亞組分析也未發(fā)現(xiàn)兩基因位點多態(tài)性與LAA型和SAO型缺血性腦卒中的發(fā)病風(fēng)險有顯著關(guān)聯(lián)性(P>0.05)。⑹未發(fā)現(xiàn)miR-146a C>G(rs2910164)、miR-149 T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)與吸煙、飲酒、高血壓病、糖尿病危險因素交互作用有顯著統(tǒng)計學(xué)意義(P

14、>0.05)。⑺miR-196a2 T>C(rs11614913)、miR-499 A>G(rs3746444)和MTHFRG>T(rs4846049)有基因-基因交互作用(P<0.05)。⑻miR-149 T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)與總膽固醇水平升高顯著相關(guān)(P<0.05),未發(fā)現(xiàn)miR-146a C>G(rs2910164)多態(tài)性位點與血脂水平有顯著關(guān)聯(lián)性(P>0.05)。
  結(jié)論:

15、①miR-146aC>G(rs2910164)和miR-149 T>C(rs2292832)多態(tài)性可能與中國漢族人群缺血性腦卒中發(fā)病易感性增加有關(guān);其多態(tài)性可能主要增加LAA型缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險。②發(fā)現(xiàn)MTHFR G>T(rs4846049)多態(tài)性可能與中國漢族人群缺血性腦卒中發(fā)病易感性增加有關(guān),可能主要增加LAA型缺血性腦卒中發(fā)病易感性。③miR-196a2T>C(rs11614913)和miR-499 A>G(rs3746444)

16、多態(tài)性可能與中國漢族人群缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險無相關(guān)性。④miR-146a C>G(rs2910164)、miR-149T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)多態(tài)性影響中國人群缺血性腦卒中的發(fā)病易感性,可能不是通過與吸煙、飲酒、高血壓病、糖尿病存在交互作用所致。⑤miR-196a2 T>C(rs11614913)、miR-499 A>G(rs3746444)和MTHFRG>T(rs4846049)之間可能存在

17、基因-基因交互作用,影響中國漢族人群缺血性腦卒中的發(fā)病易感性。⑥miR-149 T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)多態(tài)性增加中國漢族人群缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險,可能與影響血脂代謝水平有關(guān)。
  第二部分:MTHFR基因 C677T多態(tài)性與中國人群缺血性腦卒中風(fēng)險:匯總分析。
  目的:亞甲基四氫葉酸還原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)基因

18、C677T多態(tài)性與缺血性腦卒中之間的關(guān)系已被廣泛研究;然而,在不同的人群中結(jié)果是不一致的,特別是在中國人群中。綜合評價MTHFR基因C677T多態(tài)性與缺血性腦卒中之間關(guān)聯(lián)性是非常有必要的。因此,我們的研究目的是進一步去評估MTHFR基因C677T多態(tài)性與中國人群缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險的相關(guān)性。
  方法:從Pubmed、OVID、Embase、萬方數(shù)據(jù)庫、中國期刊全文數(shù)據(jù)庫(CNKI)、重慶維普數(shù)據(jù)庫(VIP)和中國生物醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)

19、庫(CBM),收集了所有截至到2014年8月的相關(guān)研究。匯總分析采用Stata12.0統(tǒng)計軟件,利用OR及其95% CI評價基因多態(tài)性與缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)強度,采用Q-檢驗和I2檢驗評價各文獻之間異質(zhì)性。采用不同的基因效應(yīng)模型、亞組分析、發(fā)表偏倚和敏感性分析,來提高分析結(jié)果的可靠性。
  結(jié)果:匯總分析結(jié)果顯示,MTHFR基因C677T多態(tài)性在總?cè)巳毫鶄€基因模型均存在顯著關(guān)聯(lián)性(加性模型: OR=1.34,95% CI:1.17-

20、1.54,P<0.001;顯性模型: OR=1.44,95% CI:1.26-1.64,P<0.001;隱性模型: OR=1.45,95% CI:1.15-1.83,P=0.001;雜合子模型:OR=1.35,95%CI:1.18-1.55,P<0.001;純合子模型: OR=1.80,95% CI:1.34-2.41,P<0.001;等位基因模型:OR=1.34,95% CI:1.17-1.53,P<0.001);亞組分析中也得到同樣

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