蘋果花芽孕育相關(guān)基因的克隆和序列分析.pdf

1、蘋果(MalusdomesticaBorkh.)是世界上重要的果樹資源之一,具有很高的營養(yǎng)價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。其花芽是混合芽,形成于開花結(jié)果的前一年,但花芽形成控制困難,管理不善很容易出現(xiàn)大小年,影響產(chǎn)量。本研究以蘋果品種‘嘎啦’為材料,對花芽孕育相關(guān)基因進(jìn)行了分段克隆,并對各基因編碼蛋白的氨基酸序列進(jìn)行了同源性分析和生物信息學(xué)分析,以期為蘋果及其他木本果樹花芽分化的調(diào)控提供理論依據(jù)及指導(dǎo)。主要研究結(jié)果如下:
　　 1.確定了適合花

2、芽孕育相關(guān)基因各片段的最佳退火溫度:MdAFL2-1的最佳退火溫度為64℃,MdAFL2-2的最佳退火溫度為63℃,MdMADS5-1的最佳退火溫度為57℃,MdMADS5-2的最佳退火溫度為55.5℃。
　　 2.通過拼接得到的MdAFL2基因長1293bp,完整開放閱讀框長1233bp,編碼410個(gè)氨基酸殘基,該蛋白序列相對分子質(zhì)量為45.37KDa,理論等電點(diǎn)6.44,不穩(wěn)定系數(shù)為41.14,顯示為弱親水性不穩(wěn)定蛋白;該蛋

3、白含有FLOLFY結(jié)構(gòu)域;預(yù)測其二級結(jié)構(gòu)主要以無規(guī)則卷曲為主,占全結(jié)構(gòu)的46.83％,并進(jìn)行了三級結(jié)構(gòu)預(yù)測。同源性分析結(jié)果表明MdAFL2與其他物種LFY同源蛋白相似度在75%以上,與蘋果亞科的同源相似度在98%以上。
　　 3.蘋果MdTFL1基因長657bp,完整開放閱讀框長519bp,編碼172個(gè)氨基酸殘基,該蛋白序列相對分子質(zhì)量19.31KDa,理論等電點(diǎn)8.82,不穩(wěn)定系數(shù)為43.87,顯示為弱親水性不穩(wěn)定蛋白;該蛋白

4、含有PEBPeuk結(jié)構(gòu)域;預(yù)測其二級結(jié)構(gòu)主要以無規(guī)則卷曲為主,占結(jié)構(gòu)總數(shù)的58.14%,并進(jìn)行了三級結(jié)構(gòu)預(yù)測。同源性分析結(jié)果表明MdTFL1與其他物種TFL1同源蛋白相似度在82%以上,與蘋果亞科的同源相似度在95%以上。
　　 4.通過拼接得到的MdMADS5基因長894bp,開放閱讀框長720bp,編碼239個(gè)氨基酸殘基,該蛋白序列相對分子質(zhì)量27.98KDa,理論等電點(diǎn)8.70,不穩(wěn)定系數(shù)53.72,顯示為親水性不穩(wěn)定蛋白