廣義多樣性增量結(jié)合關(guān)鍵位點對核小體定位預(yù)測作用的研究.pdf

1、研究核小體在基因組上精確位置的定位，對于深入理解多種生物學(xué)過程具有十分重要的意義?；谝延械暮Ａ繉嶒灁?shù)據(jù)，結(jié)合數(shù)理統(tǒng)計和機器學(xué)習(xí)方法，發(fā)展核小體的預(yù)測模型，是當下生物信息學(xué)的熱點研究領(lǐng)域。核小體定位理論雖然取得了一定進展，但是依然無法精準確定核小體的位置。我們需要進一步借助于實驗手段，提高核小體定位的精確度。
　　論文提出了廣義多樣性增量及關(guān)鍵位點算法，并圍繞廣義多樣性增量、關(guān)鍵位點結(jié)合支持向量機提出了DNA的預(yù)測模型。主要研究內(nèi)

2、容如下:
　　(1)提出核心DNA中關(guān)鍵位點的概念，并基于核心DNA中的k-mer頻數(shù)信息，結(jié)合支持向量機，提出了基于關(guān)鍵位點的核小體定位模型。模型對酵母核心DNA和連接DNA進行了分類預(yù)測，關(guān)鍵位點結(jié)合ID-SVM模型預(yù)測準確度達到了72.56％。
　　(2)在多樣性增量的基礎(chǔ)上提出了廣義多樣性增量，并結(jié)合核心DNA中k-mer頻率信息，提出了廣義多樣性增量結(jié)合關(guān)鍵位點的核小體定位預(yù)測模型。模型對酵母核心DNA和連接DNA

3、序列進行分類預(yù)測，實驗表明該模型具有良好的預(yù)測效果，gID-SVM預(yù)測準確度達到了85.35％，關(guān)鍵位點結(jié)合gID-SVM模型預(yù)測準確度達到了82.53％。
　　(3)將預(yù)測模型應(yīng)用于其他物種中，結(jié)合關(guān)鍵位點和廣義多樣性增量對雞類的親和度高的DNA序列和親和度低的DNA進行了預(yù)測，實驗的預(yù)測結(jié)果良好，關(guān)鍵位點結(jié)合ID-SVM模型準確率為89.03％，gID-SVM預(yù)測準確度為93.13％，關(guān)鍵位點結(jié)合gID-SVM模型預(yù)測準確度為