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文檔簡介
1、目的:
選擇放射增敏節(jié)點(diǎn)蛋白Rac1為研究對象,通過分子對接技術(shù),研究蒽醌化合物與Rac1蛋白的相互作用模式。并以分子對接結(jié)果為依據(jù),指導(dǎo)合成大黃酸衍生物,通過體外活性實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證其靶向性,探索靶向Rac1蛋白化合物的設(shè)計與合成的新策略。
方法:
(1)采用計算機(jī)分子對接軟件AutoDock4.2等軟件,研究蒽醌化合物與Rac1蛋白的結(jié)合模式。
(2)以大黃酸為先導(dǎo)化合物,利用有機(jī)合成反應(yīng),合成大黃酸
2、含氮的脂肪胺和哌嗪類衍生物,利用波譜技術(shù)進(jìn)行結(jié)構(gòu)解析。
(3)通過MTT實(shí)驗(yàn)、WB實(shí)驗(yàn)來檢測大黃酸衍生物對鼻咽癌、肝癌、肺癌、卵巢癌、骨肉瘤細(xì)胞的生長抑制作用和對Rac1蛋白的影響。
結(jié)果:
(1)大黃酚、大黃素、大黃酸、大黃素甲醚、蘆薈大黃素等五種常見蒽醌化合物與Rac1蛋白兩個不同活性腔都能有效對接,大黃酸與Rac1蛋白結(jié)合自由能最低。
(2)大黃酸哌嗪衍生物和大黃酸含N的脂肪胺衍生物與Rac
3、1蛋白親和力均高于大黃酸。
(3)成功合成出脂肪胺大黃酸衍生物RN-2和哌嗪類大黃酸衍生物RP-3、RP-4,并經(jīng)波譜證實(shí)。
(4) MTT實(shí)驗(yàn)表明,大黃酸衍生物RX-1和RN-2對各種腫瘤細(xì)胞的抑制率較強(qiáng),IC50值均低于大黃酸;HepG22.15細(xì)胞對大黃酸及各衍生物的敏感性最高。
(5)WB實(shí)驗(yàn)表明,四種大黃酸衍生物作用6種細(xì)胞后,除了卵巢癌SKOV3細(xì)胞外,其余5種細(xì)胞與空白組細(xì)胞相比,Rac1蛋白
4、均高表達(dá);對于鼻咽癌CNE-1和CNE-2細(xì)胞,RP-4化合物相對其他化合物對細(xì)胞的Rac1蛋白表現(xiàn)出較強(qiáng)的激活能力(P<0.001)。RN-2化合物與空白細(xì)胞比較,對于肝癌HepG22.15和肺癌A549細(xì)胞具有較強(qiáng)的Rac1蛋白激活能力(P<0.01)。
(6)分子對接及WB實(shí)驗(yàn)證實(shí),激活Rac1蛋白的大黃酸衍生物,均與Rac1蛋白活性腔中氨基酸Asn39、Ala59形成氫鍵。
結(jié)論:
Rac1蛋白可能
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