透明細胞腎細胞癌長鏈非編碼RNA表達譜分析及初步驗證.pdf

1、目的:探討及分析透明細胞腎細胞癌（ccRCC）特異性長鏈非編碼RNA（lncRNA）在腎癌及癌旁組織中的表達差異，以及可能的分子機制，篩選出有差異表達的lncRNA基因，初步驗證并建立可靠的ccRCC的lncRNA表達譜。
　　方法：利用高通量lncRNA芯片技術(shù)分別檢測3例ccRCC組織及對應癌旁組織中l(wèi)ncRNA表達譜的差異，對芯片結(jié)果進行基因本體論（Gene Ontology），通路（Pathway）分析，建立lncRNA與

2、靶基因的基因網(wǎng)絡(luò)圖，并利用實時熒光定量RT-PCR技術(shù)對87例ccRCC患者組織標本水平進行微陣列檢測結(jié)果的驗證。應用 Pearson相關(guān)性分析 lncRNA的水平與 ccRCC轉(zhuǎn)移顯著相關(guān)性。Kaplan-Meier生存分析法用于生存時間相關(guān)性。
　　結(jié)果： ccRCC患者癌組織與癌旁對照樣本間差異表達的lncRNA共3862個，其中1619個上調(diào)表達，2243個下調(diào)表達（差異表達倍數(shù)≥2.0, p<0.05）。其中表達差異最穩(wěn)

3、定且變化倍數(shù)最大的6個 IncRNA分子分別是：上調(diào)基因 LINC00944， AC011196.3，SNHG12；下調(diào)基因LINC01020，NPSR1-AS1，NONHSAT123350。實時熒光定量qRT-PCR結(jié)果顯示，該研究篩選出的6個lncRNA在87例ccRCC樣本中的表達差異與芯片檢測結(jié)果一致。Pearson相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn)僅 NONHSAT123350的水平與 ccRCC轉(zhuǎn)移顯著相關(guān)（r=0.92， P=0.0101），

4、而與患者性別、年齡等因素無關(guān)。未發(fā)生轉(zhuǎn)移的腎透明細胞癌患者中NONHSAT123350高表達組占26％，低表達占74%。生存分析結(jié)果顯示，相對于低表達組，高表達組術(shù)后生存時間更長，兩組術(shù)后中位生存時間分別是17.6個月（95% CI,13.6~21.3）和26.9個月（95%CI,23.2~30.1），差異具有統(tǒng)計學意義（P=0.0015）。
　　結(jié)論：在透明細胞腎細胞癌ccRCC組織與癌旁組織中存在大量差異表達的1ncRNA與