重性抑郁障礙長鏈非編碼RNA的篩選及初步分析.pdf

1、目的
　　1.建立重性抑郁障礙外周血白細胞中差異LncRNA/mRNA共表達網(wǎng)絡(luò)；
　　2.應用生物學與信息學手段，篩選抑郁障礙差異表達的LncRNA并進行初步分析。
　　方法
　　采用病例-對照研究，嚴格按照入排標準，收集病例組和對照組各10例，控制性別、年齡等因素后，對病例組和對照組進行一一配對，采用DSM--IV軸I障礙定式臨床檢查（SCID-I/P)對重性抑郁障礙患者進行篩查診斷，應用漢密爾頓抑郁量表(H

2、AMD)進行臨床癥狀的評定,要求病例組符合HAMD＞21分（17項）或35分（24項）。提取外周血總RNA，應用微陣列技術(shù)使用Arrystar公司LncRNA芯片（可同時檢測LncRNA/mRNA），檢測外周血白細胞中的LncRNA、mRNA并進行聚類分析,比較病例組和對照組LncRNA差異表達的情況，并建立LncRNA/mRNA的共表達網(wǎng)絡(luò)；其次，查閱文獻報道抑郁障礙密切相關(guān)的mRNA以及上述方法檢測出的差異表達mRNA，結(jié)合芯片篩選

3、出的LncRNA，按照特定基因表達標準化信號強度，篩選出差異表達中起核心調(diào)控作用的LncRNA。使用NimbleScansoftware(version2.5）對原始數(shù)據(jù)進行預處理后，采用SPSS17.0軟件包進行統(tǒng)計分析，在實驗組、對照組先控制性別年齡，采用隨機方差模型（Randomvariancemodel，RVM）校正后進行兩分類差異基因篩選(Twoclassificationdifferencegeneticscreening，

4、TwoclassDif），采用t檢驗方法，得到顯著差異表達的mRNA和LncRNA；對篩選到的差異mRNA和LncRNA進行共表達（co-expression）分析，以P＜0.05為差異有統(tǒng)計學意義，篩選出在共表達網(wǎng)絡(luò)中起核心調(diào)控作用的LncRNA，并對其進行初步分析。
　　結(jié)果
　　1.重性抑郁障礙患者外周血白細胞長鏈非編碼RNA與對照組相比，差別具有統(tǒng)計學意義（P＜0.05），共篩選出2795條差異表達mRNAs；960

5、條差異表達的LncRNAs，其中729條表達上調(diào)、231條表達下調(diào)，據(jù)此構(gòu)建重性抑郁障礙外周血白細胞中差異LncRNA/mRNA共表達網(wǎng)絡(luò)。
　　2.重性抑郁障礙患者外周血白細胞中chr1:29493450-29493605、chr1:76255317-76255564、chr3:47048304-47048512、chr5:134693047-134693150、chr10:27802593-27802714、chr10:103

6、554357-103554675、chr11:64534866-64535009、chr14:21698593-21698781、chrX:108927695-108927824、chr20:25670953-25671104、chr13：113570824-113570935等11條LncRNA的表達，差別具有統(tǒng)計學意義（P＜0.05）。
　　結(jié)論
　　1.重性抑郁障礙患者外周血LncRNA存在差異表達；
　　2.1