長鏈非編碼RNA(lncRNA)在穩(wěn)定性心絞痛中的表達譜分析.pdf

1、目的:本課題利用基因芯片及生物信息學技術(shù)，探索穩(wěn)定性心絞痛(stable angina pectoris, SAP)長鏈非編碼 RNA（long non-coding RNA，lncRNA)表達譜，篩選穩(wěn)定性心絞痛特異性lncRNA，初步探索差異表達lncRNA可能生物功能的初步信息，發(fā)現(xiàn)新的冠心病診斷的分子標記物。
　　方法：選擇穩(wěn)定性心絞痛患者及健康人群（non-SAP）各5例，抽取各自血液樣本，分別提取RNA后，利用基因芯片

2、對lncRNA和微小RNA（MicroRNA，mRNA）進行表達分析。采用散點圖、火山圖、聚類分析等方法，建立穩(wěn)定型心絞痛相關(guān)lncRNA及mRNA差異表達譜。根據(jù)FC(abc)值＞2， P＜0.05，初步篩選特異高表達lncRNA。利用生物信息學方法對差異表達的lncRNA。與 mRNA進行聯(lián)合分析。具體包括：KEGG Orthology Based Annotation System（KOBAS）分析和Gene Ontology（G

3、O）分析；lncRNA-mRNA關(guān)聯(lián)分析。預測差異表達的1ncRNA可能參與的生物功能。
　　結(jié)果：分別將SAP的1ncRNA和mRNA的表達量與non-SAP比較。 LncRNAs及mRNA表達譜差異表達基因分別為22154條和25138條；SAP組根據(jù) FC（abc）值＞2，P＜0.05標準篩選后，lncRNA共有399條，其中上調(diào)226條，下調(diào)173條。同樣標準篩選，mRNA共有458條，其中上調(diào)347條，下調(diào)111條。GO

4、功能富集包含分子代謝（能量、鋅離子代謝等）、網(wǎng)格蛋白泡膜、腫瘤壞死因子反應性、氧化應激傳導、負向調(diào)控組蛋白等相關(guān)功能；信號通路富集包含EGF受體調(diào)控、DAG及IP3調(diào)控、HSF1激活、生理節(jié)律、蛋白羧化，運送及分裂、Akt激活PI3K等相關(guān)通路；著富集到的疾病包含代謝性疾病、高血壓、動脈相關(guān)疾病、鈣離子阻滯相關(guān)疾病、認知功能減退等相關(guān)疾病。
　　結(jié)論：在穩(wěn)定性心絞痛中，lncRNA和 mRNA有大量表達顯著上調(diào)或下調(diào)，提示很大程度