METTL21C基因SNP和單倍型與男性峰值骨密度及體成分變異的核心家系關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、目的：
　　骨密度和體成分是復(fù)雜性狀，內(nèi)在互為聯(lián)系。近期研究發(fā)現(xiàn)甲基轉(zhuǎn)移酶-21C（methyltransferase-like21C，METTL21C），又名C13orf39，位于13q33.1，有264個氨基酸，是7β鏈甲基轉(zhuǎn)移酶超家族成員之一，能夠催化甲基（CH3）從供體轉(zhuǎn)移到熱休克蛋白70（Hsp70）受體上。METTL21C主要表達(dá)于肌肉中，可以通過調(diào)節(jié)NF-κB信號通路來促進(jìn)成肌細(xì)胞向肌管分化并調(diào)節(jié)肌肉內(nèi)肌漿網(wǎng)鈣離子的

2、釋放。它還可以減少糖皮質(zhì)激素誘導(dǎo)的骨細(xì)胞的凋亡。因此，本研究主要探討METTL21C基因單核苷酸多態(tài)性（SNP）和單倍型與上海地區(qū)男性峰值骨密度（peak BMD）和體成分的關(guān)系。
　　方法：
　　我們招募了400家上海市男性核心家系，其中包括400對父母和415個年齡在20-40歲的健康兒子，共1215人。根據(jù)國際人類基因組單倍型圖計劃（HapMap）數(shù)據(jù)庫，利用Haploview軟件，設(shè)定連鎖不平衡系數(shù)r2>0.8，最小

3、等位基因頻率MAF>0.05，挑選METTL21C基因全部15個標(biāo)簽SNPs（rs641652、rs660207、rs9585961、rs7988265、rs896000、rs595825、rs9518810、rs7984675、rs654454、rs3858792、rs9514044、rs7981120、rs2390760、rs966724和rs599976），并應(yīng)用imLDRTM多重SNP分型試劑盒對核心家系所有成員鑒定上述15個位

4、點的基因型。應(yīng)用雙能X線吸收儀（DAX）檢測腰椎、股骨頸和全髖部的pBMD，并檢測全身脂肪含量(total fat mass,TFM)和瘦組織含量(total lean mass,TLM)等體成分。再運(yùn)用SPSS和數(shù)量性狀傳遞不平衡（QTDT）等方法進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
　　結(jié)果：
　　應(yīng)用ANCOVA分析發(fā)現(xiàn)rs9518810和rs7984675分別與股骨頸和全髖部BMD變異相關(guān)（p分別為0.005、0.032、0.035和0.

5、035）；rs7988265、rs2390760和rs599976與BMI變異相關(guān)（p分別為0.023、0.005和0.023）；rs595825和rs654454與TLM變異相關(guān)（p=0.043，p=0.045）。QTDT家系內(nèi)相關(guān)分析發(fā)現(xiàn)rs9585961與腰椎和股骨頸BMD變異相關(guān)（p=0.035，p=0.015）；rs9518810與股骨頸BMD變異相關(guān)（p=0.028）；rs660207與TFM變異相關(guān)（p=0.024）；rs

6、7981120與BMI變異相關(guān)（p=0.042）；rs599976與BMI和TFM變異相關(guān)（p=0.012，p=0.022）。最后用1000 permutation結(jié)果顯示僅有rs9585961與腰椎和股骨頸BMD變異相關(guān)（p=0.024，p=0.043）；rs9518810與股骨頸BMD變異相關(guān)（p=0.029）；rs599976與BMI、TFM和PFM變異相關(guān)（p分別為0.025、0.043和0.044）。利用Haploview和P

7、HASE軟件得出3個單倍型區(qū)域，ANCOVA分析結(jié)果為block2中單倍型CAA與全髖部BMD變異相關(guān)（p=0.039）；CGG與股骨頸和全髖部BMD變異相關(guān)（p=0.008，p=0.031）；block3中單倍型GCTG與BMI變異相關(guān)（p=0.029）；而QTDT1000 permutation結(jié)果為block1中單倍型AG和GA與TFM變異相關(guān)(p=0.009,0.047)，block2中單倍型CAG與腰椎BMD變異相關(guān)(p=0.