基于冷凍電鏡圖像的雙鏈蛋白質(zhì)復合體結(jié)構(gòu)預測.pdf

1、因為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預測對于破譯它們的功能非常重要，一貫是生物信息學領域的研究熱門。與蛋白質(zhì)序列的測定相比，蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的檢測技術(shù)要復雜和困難得多，且針對肽鏈超過一定長度的較大蛋白質(zhì)，預測方法的結(jié)果準確性也相應下降。因此采用從序列出發(fā)的雙肽鏈蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測有一定的科研價值，也是具有挑戰(zhàn)性的課題。
　　由序列得到的單鏈結(jié)構(gòu)的預測結(jié)果往往比較準確，但肽鏈間的構(gòu)象與真實結(jié)構(gòu)并不匹配。基于冷凍電鏡圖像信息將結(jié)構(gòu)與圖形匹配的問題，可以作為圖像

2、處理中的特征信息的提取和識別問題處理。基于電鏡圖像生成的原理，可以將蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模擬成電子密度圖，通過定義目標函數(shù)對不同電鏡圖像的匹配程度進行計算。對于有雙肽鏈的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測，首先要從序列出發(fā)，通過折疊識別方法得到備選模板，然后對備選模板進行匹配和排序。在電子密度圖與結(jié)構(gòu)的匹配中，先組裝較大的單鏈結(jié)構(gòu)，在對電鏡圖進行更新后，再匹配另一條肽鏈，最后按照目標函數(shù)的值排序并輸出最佳的預測結(jié)構(gòu)。在單鏈電子密度圖匹配中，應用了模擬退火算法，提高蛋