青海湖裸鯉HIF-1αODD域羥化分析及青藏高原3種小哺乳動(dòng)物HIF-2α基因的克隆.pdf_第1頁(yè)
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1、青藏高原(Tibetan Plateau),世界海拔最高的高原,平均海拔4000-5000米,位于中國(guó)西南地區(qū),氣候干燥,空氣稀薄,太陽(yáng)輻射較強(qiáng),氣溫較低。且高原自然生態(tài)系統(tǒng)脆弱,易受外界因素干擾破壞。低氧誘導(dǎo)因子(Hypoxia-induciblefactor,HIF),是由α亞基和β亞基組成的異二聚體轉(zhuǎn)錄因子,其活性主要由α亞基決定,能夠?qū)Χ喾N下游基因進(jìn)行調(diào)控,從而使細(xì)胞適應(yīng)低氧,維持低氧細(xì)胞生理穩(wěn)態(tài)。目前已知的HIF家族包括:HI

2、F-1,HIF-2和HIF-3,其α亞基分別為HIF-1α,HIF-2α和HIF-3α,它們都對(duì)細(xì)胞內(nèi)氧分壓敏感,受氧濃度的調(diào)節(jié)。研究表明,青海湖裸鯉HIF-1α的ODD功能域中的羥化酶識(shí)別位點(diǎn)的保守序列為:PEMLAP(550-555),與其它脊椎動(dòng)物保守序列(LXXLAP,X代表任意氨基酸)不符,可能致使青海湖裸鯉具有與普通魚(yú)類(lèi)不同的適應(yīng)低氧機(jī)制。目前HIF的研究主要集中在HIF-1α,對(duì)HIF-2α的分子結(jié)構(gòu)、表達(dá)特征及低氧狀態(tài)下

3、的調(diào)控機(jī)制了解有限,因此,通過(guò)研究青海湖裸鯉HIF-1α羥基化作用的差異及青藏高原4種脊椎動(dòng)物HIF-2α分子進(jìn)化,對(duì)進(jìn)一步闡明裸鯉和高原小哺乳動(dòng)物的低氧適應(yīng)機(jī)制,具有重要的理論和實(shí)踐意義。
  首先提取青海湖裸鯉(Gymnocypris przewalskii)肝臟組織總RNA,通過(guò)RT-PCR獲得裸鯉HIF-1α的cDNA全長(zhǎng),克隆HIF-1α基因1546-1752序列(包含PEMLAP,氨基酸序列516-584),對(duì)克隆片段

4、1649進(jìn)行點(diǎn)突變(序列為L(zhǎng)EMLAP),克隆到表達(dá)載體pGEX-4T-2中(突變后命名為OE,野生型為HI),IPTG誘導(dǎo)表達(dá),并用GST Resin純化得到重組蛋白GST-HI及GST-OE蛋白,冷凍干燥備用。
  提取斑馬魚(yú)總RNA,通過(guò)RT-PCR獲得PHD2的cDNA全長(zhǎng),克隆PHD2編碼區(qū)序列到pET-32表達(dá)載體,IPTG誘導(dǎo)表達(dá),用Ni柱純化得到trx-PHD2重組蛋白,4℃過(guò)夜透析,經(jīng)Bradford法測(cè)定透析后

5、重組蛋白pET-32-PHD2濃度為1mg/mL,將GST-HI/GST-OE進(jìn)行HPH反應(yīng),western blot檢測(cè)。發(fā)現(xiàn)GST-HI/GST-OE均能與PHD2通過(guò)底物/酶相互作用結(jié)合,但GST-OE與GST-HI相比對(duì)PHD2具有更高的親和力,同時(shí),GST-OE條帶羥化后電泳遷移率發(fā)生改變,羥化的GST-OE電泳遷移率略快于未羥化的GST-OE條帶,而GST-HI條帶未發(fā)現(xiàn)遷移率的差異,表明重組蛋白trx-PHD2具有一定的羥

6、化活性,重組蛋白GST-OE被PHD2識(shí)別結(jié)合并羥化的能力要明顯高于重組蛋白GST-HI,說(shuō)明與其它魚(yú)類(lèi)相比,青海湖裸鯉的HIF-1α的ODD功能域不易被羥化酶識(shí)別和羥化,可能是青海湖裸鯉長(zhǎng)期進(jìn)化適應(yīng)高原鹽湖環(huán)境的結(jié)果。
  通過(guò)提取青海湖裸鯉(Gymnocypris przewalskii)、高原鼢鼠(Myospalaxbaileyi根田鼠(Microtus oeconomus)及高原鼠兔(Ochotona curzoniae)

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