基于網(wǎng)格計算環(huán)境的蛋白質(zhì)折疊模擬應(yīng)用的開發(fā)及應(yīng)用調(diào)度器的研究.pdf

1、在國家863項目"建設(shè)合肥網(wǎng)格節(jié)點及開發(fā)若干典型應(yīng)用"的支持下,中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)國家高性能計算中心、網(wǎng)絡(luò)中心和科大生命學(xué)院分子計算實驗室合作開發(fā)這個基于網(wǎng)格計算環(huán)境的生物計算應(yīng)用.作為該項目的子項目,我們在科大校園網(wǎng)平臺上開發(fā)并實現(xiàn)了基于網(wǎng)格環(huán)境的蛋白質(zhì)折疊分子動力學(xué)模擬分布式計算.在該項目中,我們開展了以下研究:利用當(dāng)前網(wǎng)格計算和服務(wù)最新技術(shù)Web Service和Grid Service,設(shè)計并實現(xiàn)了基于網(wǎng)格計算環(huán)境的蛋白質(zhì)折疊模擬

2、的分布式計算模型,在生物計算領(lǐng)域有著重要的應(yīng)用價值.同時,它整合了當(dāng)前先進(jìn)的網(wǎng)絡(luò)計算技術(shù),在算法上和平臺建設(shè)上有著廣泛的指導(dǎo)和示范意義.研究設(shè)計了應(yīng)用程序調(diào)度代理,它的主要功能就是根據(jù)網(wǎng)格系統(tǒng)中現(xiàn)有資源的可利用情況和當(dāng)前請求作業(yè)的應(yīng)用需求特點,確定作業(yè)分解、任務(wù)/資源分配的最佳方案.細(xì)致而有效的應(yīng)用調(diào)度器是讓網(wǎng)格資源為應(yīng)用程序提供良好執(zhí)行性能的必要保證.這些工具在國外已經(jīng)有了一些成功的經(jīng)驗,但在國內(nèi)還是剛剛起步,很多東西需要進(jìn)一步的研究