約束條件下的序列比對算法的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、該文在分析了Smith-Waterman算法的基礎上,根據前人提出的一些改進方案,針對Smith-Waterman算法產生的比對結果中的"馬賽克效應"和"陰影效應",以及算法的時空復雜度過大,比對不能有效體現生物分子的功能性意義等不足,綜合多種分子生物學特征的約束條件,提出了一種新型的序列比對模型——約束條件下的序列比對.這種模型通過引入具有生物學意義的先驗數據來構造替代矩陣,運用仿射型函數來處理罰分策略,使得時間復雜度由O(n<'2>

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