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文檔簡介
1、研究背景:白癜風(fēng)是一種常見的原發(fā)性皮膚黏膜色素脫失性疾病,其發(fā)病機(jī)制尚不十分清楚,主要涉及黑素細(xì)胞自毀學(xué)說、生物學(xué)說、神經(jīng)學(xué)說、自身免疫學(xué)說和遺傳學(xué)說等,且自身免疫學(xué)說被越來越多研究所證實(shí)。近幾年,GWAS被廣泛用于研究復(fù)雜疾病的易感基因。在歐洲和中國,已有兩個團(tuán)隊運(yùn)用了GWAS的研究方法,發(fā)現(xiàn)了一些與白癜風(fēng)相關(guān)的易感基因,并且在不同的人群中得到了驗證。主要包括SMOC2,PTPN22,RERE,C1QTNF6,GZMB等基因上的SNP
2、點(diǎn),這些免疫易感位點(diǎn)與白癜風(fēng)密切相關(guān),其中某些易感基因可調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答,并與其他自身免疫性疾?。ㄈ鐦虮臼霞谞钕傺?、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎)高度相關(guān)。截止目前,運(yùn)用GWAS發(fā)現(xiàn)總共70多個與白癜風(fēng)相關(guān)的易感位點(diǎn),其中一些免疫易感位點(diǎn)尚未在漢族人群白癜風(fēng)伴自身免疫性疾病中獲得驗證。
目的:探討白癜風(fēng)相關(guān)的免疫易感基因位點(diǎn)與漢族人群白癜風(fēng)伴自身免疫性疾病的相關(guān)性,以搜尋不同種族人群間白癜風(fēng)共同的免疫易感基因。
方法:收集白癜風(fēng)伴自身
3、免疫性疾病病例552例和正常對照1,656例;在前期GWAS發(fā)現(xiàn)的易感基因的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上,共挑選了分別位于基因 ATP8B1,CLNK,LPP,GZMB,IKZF4,RPGRIP1L,CASP7,CD80,IL2RA的10個點(diǎn)rs10503019 at18q21.31,rs11940117 at4p16.1,rs1464510 at3q28,rs2273844 at14q12,rs2456973 at12q13.2,rs3213758 a
4、t16q12.2,rs4353229 at10q25.3,rs59374417 at3q13.33,rs706779和rs7090530 at10p15.1驗證。利用Sequenom Massarray系統(tǒng),對所選標(biāo)本進(jìn)行基因分型;應(yīng)用PLINK1.07對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,了解這些位點(diǎn)是否為漢族人群和外國人群共同的易感位點(diǎn)(P≤0.05具有統(tǒng)計學(xué)意義)。
結(jié)果:1.關(guān)聯(lián)分析顯示:ATP8B1,CLNK,LPP,GZMB,IKZF4
5、,RPGRIP1L,CASP7,CD80,IL2RA的10個點(diǎn)rs10503019 at18q21.31,rs11940117 at4p16.1,rs1464510 at3q28,rs2273844 at14q12,rs2456973 at12q13.2,rs3213758 at16q12.2,rs4353229 at10q25.3,rs59374417 at3q13.33,rs706779和rs7090530 at10p15.1。rs
6、2456973和rs11940117的等位基因頻率在病例組(552例)和對照組(1,656例)之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.003,P=0.01)。分別進(jìn)行校正后,rs2456973在病例組和對照組之間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.003<0.05/10),但是rs11940117在兩組間的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.01>0.05/10)。
2.分層分析顯示:將白癜風(fēng)患者按發(fā)病類型、嚴(yán)重程度以及伴發(fā)疾病類型等亞臨床表型進(jìn)行分層分析
7、,顯示rs2456973在有白癜風(fēng)發(fā)病年齡的患者中,其等位基因頻率在早發(fā)型和對照組之間、早發(fā)型和晚發(fā)型患者之間有差異(P=0.0001,OR=1.72,95%CI=1.30-2.28;P=0.01,OR=0.67,95%CI=0.49-0.91)。Rs11940117在有白癜風(fēng)伴發(fā)自身免疫性疾病的患者中,其等位基因頻率在白癜風(fēng)伴類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎患者和對照組之間、白癜風(fēng)伴類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎和白癜風(fēng)不伴類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎患者之間有差異(P=0.005
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