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1、分類號(hào): 密級(jí): U D C:學(xué)號(hào):416523212194 南 昌 大 學(xué) 碩 士 研 究 生 學(xué) 位 論 文 LncRNA 在前列腺增生性炎性萎縮向前列腺癌 前列腺增生性炎性萎縮向前列腺癌 惡性轉(zhuǎn)化 惡性轉(zhuǎn)化過程 過程中差異表達(dá) 差異表達(dá)的初步 初步研究 研究 Differentially Expression of Long non-coding RNA
2、s in the Malignant Transformation from Proliferative Inflammatory Atrophy to Prostate Carcinoma: An Preliminary Study 郝 超 培養(yǎng)單位(院、系) :南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院 指導(dǎo)教師姓名、職稱:王共先 教授 申請(qǐng)學(xué)位的學(xué)科門類:醫(yī)學(xué) 學(xué)科專業(yè)名稱:外科學(xué)(泌尿外) 論文答辯日期:2015 年 6 月 答辯委員會(huì)主席:
3、 評(píng)閱人: 2015 年 6 月摘要 II 摘 要 目的: 目的: 利用微陣列基因芯片技術(shù)檢測(cè)前列腺癌(PCa) 、前列腺增生性炎性萎縮(PIA)和癌旁非癌組織中差異表達(dá)的 mRNA 和 lncRNA。觀察前列腺惡性轉(zhuǎn)化過程中基因表達(dá)的動(dòng)態(tài)變化,進(jìn)而發(fā)現(xiàn)可能存在的前列腺非可控性炎癥至惡性癌變過程中的特征分子網(wǎng)絡(luò),為 PIA→PCa 發(fā)病模式提供分子層面的新證據(jù),以期為臨床前
4、列腺癌的預(yù)防、診療,以及發(fā)病機(jī)制提供新理論及新方案。 方法: 方法: 收集 2013 年 8 月至 2014 年 8 月我院前列腺切除術(shù)后臨床組織標(biāo)本共 20 例,通過改進(jìn)標(biāo)本獲取方式,運(yùn)輸途徑,破碎方法三方面因素,建立從離體組織標(biāo)本提取高質(zhì)量總 RNA 的方法。隨后在此方法基礎(chǔ)上,通過冰凍切片結(jié)合手工顯微切割技術(shù)在同一前列腺組織標(biāo)本中分離出 PCa、 PIA 及癌旁非癌組織各區(qū)域的純凈細(xì)胞群。采用 lncRNA+mRNA 表達(dá)譜芯片
5、分析三者間的基因表達(dá)差異(生物學(xué)重復(fù) 3 次) ,通過生物信息學(xué)的方法篩選出具有顯著表達(dá)差異的 mRNA 和lncRNA,并對(duì)結(jié)果進(jìn)行 Pathway 分析等初步的生物信息學(xué)分析,反向 Cis-預(yù)測(cè)lncRNA 的靶基因, 在發(fā)生顯著變化的炎癥和/或癌癥通路上建立 lncRNA 與靶基因的基因網(wǎng)絡(luò)圖。 結(jié)果: 結(jié)果: 1. 前列腺癌根治術(shù)后獲取的離體組織標(biāo)本,在 30min 內(nèi)放入液氮凍存,經(jīng)液氮研磨或冰凍切片均可以提取到高質(zhì)量的總 R
6、NA(RIN>7.5) 。 2. 手工顯微切割獲取的組織,可通過 Trizol 法提取到滿足高通量微陣列技術(shù)要求的高質(zhì)量 RNA,但 H&E 染色會(huì)降低 RNA 的完整性。 3. 基因表達(dá)譜芯片的結(jié)果顯示: 人前列腺癌組織與癌旁非癌組織對(duì)照相比,有 2610 個(gè) mRNA 表達(dá)有差異,其中上調(diào) 689 個(gè),下調(diào) 1921 個(gè);同時(shí)有 2176個(gè) lncRNA 表達(dá)有差異,其中上調(diào) 688 個(gè),下調(diào) 1488 個(gè)。人前列腺增
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