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文檔簡介
1、目的: 腎素-血管緊張素系統(tǒng)(Renin-angiotensinsystem,RAS)是體內(nèi)最重要的血壓調(diào)節(jié)系統(tǒng),血管緊張素Ⅱ(angiotensinⅡ,Ang2)Ⅰ型受體(AT1)是腎素-血管緊張素系統(tǒng)重要的組成成分。Ang2主要與AT1受體結(jié)合發(fā)揮收縮血管和調(diào)節(jié)醛固酮分泌的作用,從而調(diào)節(jié)血壓和機體的循環(huán)血量?;蚨鄳B(tài)和疾病的連鎖分析是目前研究多基因疾病分子生物學(xué)基礎(chǔ)的常用方法。而單核苷酸多態(tài)(singlenucleotide
2、polymorphisms,SNP)是基因組中存在最多的多態(tài)。該研究旨在探討血管緊張素Ⅱ-1型受體基因單核苷酸多態(tài)與原發(fā)性高血壓的相關(guān)性,在分子生物學(xué)水平上探討高血壓病的病因。 方法: (1)選取山東地區(qū)原發(fā)性高血壓患者192名(排除糖尿病和高脂血癥患者)為高血壓組。隨機選擇20名高血壓患者做為篩查SNP的樣本。選取192例無高血壓、糖尿病及高血脂血癥的正常人為正常血壓對照組。兩組年齡、體重指數(shù)、空酸血糖、總膽固醇、LD
3、L膽固醇、HDL膽固醇、尿素氮、肌苷均沒有統(tǒng)計學(xué)水平的差異(P>0.05)。高血壓組收縮壓(156±18)mmHg,而對照組為(113±10)mmHg(P<0.01),高血壓組舒張壓(97±12)mmHg,而對照組為(74±8)mmHg(P<0.01)。 (2)DNA提取用常規(guī)酚-氯仿法提取外周血白細(xì)胞DNA,用瓊脂糖凝膠電泳測定DNA濃度,并標(biāo)化濃度值至20ng/ul。 (3)設(shè)計引物在美國國立生物技術(shù)信息中心數(shù)據(jù)庫中
4、獲得AT1基因組序列(序列號AF245699),與其mRNA序列(NM-000685)進(jìn)行序列對比標(biāo)出啟動子(promoter)區(qū)、5’非翻譯(5’UTR)區(qū)、內(nèi)含子(Intron)區(qū)、編碼(coding)區(qū)和3’非翻譯(3’UTR)區(qū)。利用Whitehead基因組中心的primer3軟件對調(diào)控區(qū)、外顯子和鄰近外顯子的內(nèi)含子設(shè)計引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。 (4)PCR反應(yīng)在96孔板上進(jìn)行,采用25ul反應(yīng)體系,其中包括人基因組20ng
5、,10×PCR緩沖液2.5ul,25mmol/LMC122ul,10mmol/L,dNTP0.5ul,10umol/L引物0.8ul,5U/uLTaqDNA聚合酶0.2ul,PCR儀為GeneAmp9700PCR儀。PCR反應(yīng)條件為Touchdown程序預(yù)變性95℃2min,94℃變性30S,退火溫度在起始的10個循環(huán)中為63℃-58℃,每次遞減0.5℃,反應(yīng)60S,延伸72℃40S,在以后的30個循環(huán)中,退火溫度固定為58℃,每次反應(yīng)
6、40S,最后延伸7min以終止所有反應(yīng)。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳驗證。 (5)SNP的發(fā)現(xiàn)和檢測PCR擴(kuò)增的目的片段經(jīng)樹脂(wizardPCRPrepsDNApurificationresin,Promega)純化后,用ABI-PRISMTMBig-Dye末端標(biāo)記試劑盒(PE,F(xiàn)osterCity,CA),以PCR引物為測序引物進(jìn)行雙向測序反應(yīng)。測序反應(yīng)條件為96℃變性10s,50℃退火5s,60℃延伸4min,35個循環(huán)
7、。產(chǎn)物經(jīng)乙醇沉淀,ABI377DNA測序儀進(jìn)行熒光標(biāo)記末端終止法雙向測序,進(jìn)一步用Polyphred軟件進(jìn)行序列的判讀和SNP確認(rèn)。 (6)SNP的基因分型:對具有SNP片段在192個高血壓和192個對照中進(jìn)行擴(kuò)增,直接測序,用Polyphred軟件讀出每一個每個樣本的基因型。 (7)統(tǒng)計學(xué)分析采用SAS統(tǒng)計學(xué)軟件對兩組進(jìn)行病例對照分析,組間比較采用x2檢驗,P<0.05認(rèn)為有統(tǒng)計學(xué)差別。 結(jié)果: ATl
8、基因中共檢測出11個SNP,其中G165T和G250T是該研究首次報道,NCBISNP數(shù)據(jù)庫中還沒有收錄。對其中8個頻率大于5%的SNP在192個高血壓病人中和192個正常血壓對照組中進(jìn)行基因分型,顯示G-52lT多態(tài)(rsl492078)在原發(fā)性高血壓患者中T等位基因的頻率是29.4%,而對照組中T等位基因頻率為21.1%,其分布在兩組中有顯著統(tǒng)計學(xué)意義上的差別,P<0.0l,而以前被廣泛研究的A1166C多態(tài)(rs5186)則沒有顯
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