單核苷酸多態(tài)與胃癌侵襲相關(guān)性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、中國醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文單核苷酸多態(tài)與胃癌侵襲相關(guān)性研究姓名:李愛琳申請學(xué)位級別:博士專業(yè):臨床醫(yī)學(xué);腫瘤學(xué)指導(dǎo)教師:王振寧201205提取的DNA樣本,并收集匹配的404例健康個體外周血提取的DNA樣本,利用MALDITOFMS進(jìn)行基因型分析,目的為研究肝素酶基因和NMEl基因單個SNPs位點(diǎn)及其構(gòu)成的單體型與胃癌易感性、臨床病理特征及預(yù)后的相關(guān)性,以尋找功能性SNPs及單體型作為預(yù)測胃癌侵襲能力及預(yù)后的分子標(biāo)記,這對胃癌的防治具有重

2、要的意義。方法1、實(shí)驗(yàn)標(biāo)本收集病例組標(biāo)本來源為404例胃癌患者術(shù)后石蠟包埋正常胃組織,對照組標(biāo)本來源為年齡性別與病例組一比一匹配404名健康人外周血。2、基因組DNA提取福爾馬林固定的石蠟包埋組織應(yīng)用QIAamp@DNAFFPE提取試劑盒(德國)提取DNA,外周血DNA提取應(yīng)用TaKaRa全基因組DNA提取試劑盒,依說明書描述操作。3、基因分型我們使用MALDITOFMS方法進(jìn)行基因分型,針對每一個SNP分別設(shè)計正向引物、反向引物、延伸

3、探針,按樣品數(shù)的1%加入陰性對照,按樣品數(shù)的1%N入室內(nèi)質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品對照,按樣品數(shù)的5%隨機(jī)選取樣品做為重復(fù)實(shí)驗(yàn)復(fù)核。基因型分析的操作人員不知道所檢測標(biāo)本的病例或?qū)φ諏傩浴?、統(tǒng)計分析統(tǒng)計分析用PASWStatisticslg0(SPSS,Inc,Somers,NY,USA)軟件進(jìn)行應(yīng)用了貯檢驗(yàn),置換檢驗(yàn),非條件性logistic回歸模型,KaplanMeier生存分析,logrank檢驗(yàn),單因素和多因素Cox回歸分析。并使用Haplov

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