B7-H2基因3’-UTR內(nèi)的單核苷酸多態(tài)性與胃癌發(fā)生相關(guān)性的研究.pdf

1、目的：研究B7-H2基因3’-UTR內(nèi)的單核苷酸多態(tài)性(SNP)與胃癌發(fā)生的相關(guān)性,并進(jìn)一步探討胃癌組織中B7-H2表達(dá)下調(diào)的機(jī)制。
　　方法：1.運(yùn)用生物信息學(xué)軟件篩選出位于B7-H2基因3’-UTR內(nèi)的SNP位點(diǎn)及可能存在的miRNA結(jié)合位點(diǎn);選擇位于預(yù)測(cè)的miRNA結(jié)合位點(diǎn)內(nèi)的,且較小等位基因頻率(MAF)大于10％的SNP進(jìn)行研究。2.收集183例胃癌患者及348例正常人的外周血樣本,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長(zhǎng)度分析

2、法(PCR-RFLP)檢測(cè)所收集的樣本中該SNP的基因型分布,分析不同基因型與胃癌發(fā)生及臨床病理參數(shù)的關(guān)系。3.采用雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)分析所預(yù)測(cè)的miRNA對(duì)B7-H2基因表達(dá)的調(diào)控作用,進(jìn)一步探討調(diào)控機(jī)制。
　　結(jié)果：1.從SNP數(shù)據(jù)庫(kù)中查找到40個(gè)位于B7-H2基因3′-UTR的SNP位點(diǎn);較小等位基因頻率(MAF)大于10％的SNP有rs15927,rs3804033,rs55769116,rs4819388和rs557

3、69116,其中rs4819388位于miR-24與B7-H2基因3’-UTR結(jié)合區(qū)內(nèi),因此選取該SNP進(jìn)行研究。2.數(shù)據(jù)分析顯示SNP rs4819388與胃癌的發(fā)生密切相關(guān)。在胃癌患者中,GA雜合子所占比例明顯高于 GG純合子(55.7％ vs32.8％,OR=1.60,95％CI=1.08–2.37);相對(duì)于GG純合子,基因型為AA的個(gè)體發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的可能性顯著增高(OR=9.27,95％CI=1.16–74.2,p=0.017

4、),腫瘤細(xì)胞低分化的可能性更大(OR=8.16,95％CI=0.98–67.8,p=0.043),TNM分期為III/IV期的可能性更大(OR=4.75,95％CI=1.01–22.4,p=0.046);A等位基因在發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(OR=1.76,95％CI=1.05-2.95,p=0.034)和/或TNM分期為III/IV期(OR=1.80,95％CI=1.07-3.04,p=0.032)的患者中的頻率明顯高于G等位基因。3.雙熒光素