小麥抗旱相關(guān)基因的單核苷酸多態(tài)性分析.pdf

1、水資源短缺是人類面臨的嚴(yán)重生態(tài)問題,發(fā)掘利用抗旱種質(zhì)資源,培育抗旱節(jié)水作物品種,是緩解水資源短缺矛盾的重要途徑,其中優(yōu)異抗旱種質(zhì)資源的發(fā)掘和利用是基礎(chǔ).該研究的目的是通過分析小麥種質(zhì)資源抗旱相關(guān)基因的單核苷酸多態(tài)性(SNP),為育種工作者有針對性地選用遺傳基礎(chǔ)多樣性較高的抗旱親本提供依據(jù),為發(fā)掘小麥分子標(biāo)記、構(gòu)建高密度遺傳圖譜奠定基礎(chǔ).該研究以中國北方冬麥區(qū)不同地區(qū)、不同年代的96份旱地和水地栽培的小麥品種(系)為材料,篩選了29個抗旱

2、相關(guān)基因片段(cDNA),其中12個基因(EST)來自課題組構(gòu)建的小麥幼苗水分脅迫誘導(dǎo)表達(dá)的cDNA文庫,17個來自GenBank數(shù)據(jù)庫,主要包括HAVL、LEA protein、CBF3-like protein(BCBF3)、DRE binding factor基因等,并初步分析了其中的11個抗旱相關(guān)基因(cDNA)的單核苷酸多態(tài)性.結(jié)果如下:(1)在29對抗旱相關(guān)基因的引物中,有18對擴(kuò)增效果較好,擴(kuò)增產(chǎn)物片段大小符合預(yù)期目標(biāo),但

3、在96份小麥抗旱種質(zhì)資源中沒有發(fā)現(xiàn)片段長度多態(tài)性,說明抗旱相關(guān)基因在小麥中的片段長度多態(tài)性頻率非常低.(2)對11對引物3634bp的PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序分析,發(fā)現(xiàn)了106個SNP,平均34個堿基中有1個SNP,說明小麥中的單核苷酸多態(tài)性非常豐富.(3)基因中的SNP分布不均,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的SNP中,有99個在編碼區(qū),平均32個堿基中有1個SNP;7個在非編碼區(qū),平均69個堿基中有1個SNP.(4)SNP的堿基變換類型中,轉(zhuǎn)換(C與T或G與A