分子對接研究神經(jīng)氨酸酶與3-(3-戊氧基)安息香酸作用機(jī)制.pdf

1、流行性感冒是由流感病毒引起的上呼吸道疾病,每年有數(shù)百萬人受到流感病毒感染。近來,全球范圍內(nèi)爆發(fā)的H1N1流感即屬于其中的一個(gè)亞型,由于人類對流感病毒普遍缺乏免疫力以及H1N1亞型流感對人類的高致病率,世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)認(rèn)為這是對人類存在的潛在威脅之一。截至目前為止,人類對流感病毒一直缺乏安全有效的防控手段,使得抗流感病毒藥物研究成為當(dāng)前藥學(xué)研究的一個(gè)熱點(diǎn)。
　　 分子對接是

2、計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方法之一,是目前國內(nèi)外前沿課題,具有多學(xué)科綜合交叉的特點(diǎn)。利用計(jì)算機(jī)模式識(shí)別和優(yōu)化技術(shù),在現(xiàn)有結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫中搜索能與特定藥物作用靶點(diǎn)在幾何和化學(xué)上相匹配的分子,實(shí)現(xiàn)計(jì)算機(jī)輔助藥物篩選,節(jié)省了大部分化合物合成試驗(yàn)時(shí)間和購買以及實(shí)際生物測試的花費(fèi),很大程度上加快了新藥研發(fā)的過程并降低了研發(fā)成本。
　　 本文運(yùn)用分子對接和分子動(dòng)力學(xué)方法,深入研究了4-(氮-乙酰氨基)-5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)與各類

3、型神經(jīng)氨酸酶(N1、N2、N9亞型和B型)間的作用機(jī)制。并得出相關(guān)結(jié)論,4-(氮-乙酰氨基)-5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)與各類型神經(jīng)氨酸酶結(jié)合模式存在差異,但作用機(jī)制比較相似,與它們的活性腔均匹配良好,并可以形成穩(wěn)定的復(fù)合體系,最大結(jié)合能分別為-295.12、-331.51、-158.64、-253.33 kcal·mol-1。這表明BA對各類型神經(jīng)氨酸酶均有良好的抑制效果。經(jīng)進(jìn)一步研究分析發(fā)現(xiàn),4-(氮-乙酰氨基)-

4、5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)與各類型神經(jīng)氨酸酶活性腔內(nèi)保守關(guān)鍵氨基酸殘基發(fā)生較強(qiáng)的靜電和氫鍵作用,而與易突變氨基酸殘基作用較弱,表明了活性腔內(nèi)易突變氨基酸殘基發(fā)生突變也不會(huì)對抑制效果造成明顯影響。因此,4-(氮-乙酰氨基)-5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)是一種極具應(yīng)用前景的新型抗流感病毒藥物。結(jié)合以前的研究結(jié)果,我們提出了以4-(氮-乙酰氨基)-5-胍基-3-(3-戊氧基)安息香酸(BA)為底物的抗流感病毒