應(yīng)用RNAi文庫(kù)篩選HBV復(fù)制相關(guān)基因.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:應(yīng)用RNAi文庫(kù)建立一種篩選HBV復(fù)制相關(guān)基因的方法,篩選參與HBV復(fù)制的基因,為探討HBV復(fù)制的機(jī)理,開發(fā)抗乙肝病毒新藥提供新的靶點(diǎn)。 方法:(1)建立并驗(yàn)證篩選策略:構(gòu)建HBx-siRNA及HBs-siRNA并感染HepG2.2.15細(xì)胞,MEIA法檢測(cè)細(xì)胞上清中HBsAg,HBeAg的表達(dá)量,定量RT-PCR檢測(cè)細(xì)胞上清中HBV DNA及細(xì)胞內(nèi)cccDNA的含量,F(xiàn)ACS檢測(cè)細(xì)胞表面HBsAg的表達(dá)水平。(2)基因篩

2、選并驗(yàn)證:將RNAi文庫(kù)感染HepG2.2.15細(xì)胞,利用免疫磁珠收集HBsAg表達(dá)降低的細(xì)胞,提取DNA,PCR擴(kuò)增siRNA編碼序列,將PCR產(chǎn)物克隆入T-easy,隨機(jī)挑選單克隆測(cè)序后選取感興趣的基因,合成其相應(yīng)的siRNA轉(zhuǎn)入HepG2.2.15細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行驗(yàn)證。Western blot檢測(cè)被抑制基因編碼的蛋白表達(dá)水平,MEIA法及定量RT-PCR檢測(cè)HBV復(fù)制情況,F(xiàn)ACS檢測(cè)細(xì)胞表面HBsAg的表達(dá)水平。 結(jié)果:(1)

3、HBx-siRNA及HBs-siRNA感染HepG2.2.15細(xì)胞后細(xì)胞上清中病毒蛋白(HBsAg,HBeAg)及HBV DNA表達(dá)量均低于對(duì)照組,細(xì)胞內(nèi)cccDNA的相對(duì)表達(dá)量也較對(duì)照組下降。FACS結(jié)果提示抑制HBx或HBs的表達(dá)均能夠降低HepG2.2.15細(xì)胞表面HBsAg的表達(dá)量。(2)在隨機(jī)挑選的克隆中成功測(cè)序20個(gè),其中一個(gè)克隆含有DDB1的編碼序列(可能參與HBV復(fù)制),另一個(gè)克隆含有KIAA1919的編碼序列,余下18

4、個(gè)克隆的序列不能定位于任何基因。構(gòu)建DDB1-siRNA并轉(zhuǎn)染HepG2.2.15細(xì)胞后Western blot檢測(cè)顯示DDB1蛋白被抑制;MEIA法及定量RT-PCR顯示細(xì)胞上清中病毒蛋白(HBsAg,HBeAg)及HBVDNA表達(dá)量均低于對(duì)照組;細(xì)胞內(nèi)cccDNA的相對(duì)表達(dá)量較轉(zhuǎn)染前明顯下降;FACS結(jié)果也顯示抑制DDB1的表達(dá)能夠降低HepG2.2.15細(xì)胞表面HBsAg的表達(dá)量。 結(jié)論:本試驗(yàn)建立了一種篩選HBV復(fù)制相關(guān)

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