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文檔簡介
1、miRNA主要通過與靶mRNA的3’端結(jié)合降解或抑制靶基因的翻譯,從而對靶基因進行轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。由于miRNA識別靶基因并不是一一對應(yīng)的關(guān)系,存在著幾個不同的miRNA聯(lián)合調(diào)控同一個靶基因的可能,而一個miRNA也可能調(diào)控多個靶基因。我們之前研究發(fā)現(xiàn),斑馬魚中cyb561d2是miR-155的靶基因,并且在氟蟲腈(5-氨基-1-[2,6-二氯4-(三氟甲基)苯基]-4-[(三氟甲基)亞磺?;鵠-1H-吡唑-3-腈)的脅迫下cyb561d2
2、的表達受miR-155的調(diào)控。在本實驗中,我們通過Microcosm Targets預(yù)測發(fā)現(xiàn)cyb561d2有可能是miR-194a、miR-216b、miR-429和miR-499共同的靶基因,通過實驗驗證了這4個miRNAs分別與cyb561d2之間的關(guān)系。我們評估了氟蟲腈暴露下斑馬魚中這4個miRNAs的表達,研究4種miRNAs能否調(diào)控cyb561d2的表達,結(jié)果發(fā)現(xiàn)隨著氟蟲腈處理濃度的升高,斑馬魚中miR-216b和miR-4
3、99的表達量明顯下調(diào),而miR-194a與miR-429的表達量卻沒有明顯變化。
為了解釋氟蟲腈處理后miRNA表達的變化,同時驗證生物信息學(xué)預(yù)測的結(jié)果。我們通過重疊延伸PCR將cyb561d23’-UTR中miR-194a、miR-216b、miR-429和miR-499推定結(jié)合位點分別敲除,成功構(gòu)建了4個重組海腎熒光素酶載體,分別命名為pRL/S-K.O-194a、pRL/S-K.O-216b、pRL/S-K.O-429、
4、pRL/S-K.O-499。通過雙熒光素酶報告基因法驗證了斑馬魚cyb561d23’-UTR中存在miR-216b和miR-499的結(jié)合位點,而并不存在miR-194a和miR-429的直接結(jié)合位點。
我們通過對ZF4細胞轉(zhuǎn)染miR-499 mimic后,檢測細胞中cyb561d2的表達量,發(fā)現(xiàn)cyb561d2在mRNA水平及蛋白水平都顯著下調(diào),而轉(zhuǎn)染miR-499 inhibitor后,cyb561d2的mRNA水平及蛋白水
5、平則顯著上調(diào),同樣的對ZF4細胞轉(zhuǎn)染miR-216b mimic后,cyb561d2的表達量下調(diào),轉(zhuǎn)染miR-216b inhibitor后, cyb561d2的表達量則顯著上調(diào),然而對ZF4轉(zhuǎn)染miR-194a或miR-429 mimic,細胞中cyb561d2 mRNA的表達并沒有發(fā)生明顯的變化。綜上所述,我們發(fā)現(xiàn)cyb561d2是miR-216b和miR-499的靶基因,而不是miR-194a和miR-429的靶基因,而在氟蟲腈暴
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