黃曲條跳甲關(guān)鍵功能基因的克隆及利用RNAi技術(shù)控制害蟲.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、黃曲條跳甲Phyllotreta striolata(Fabricius)(鞘翅目Coleoptera:葉甲科Chrysomelidae)是廣泛分布于世界各地的重要害蟲。本論文從黃曲條跳甲能量代謝系統(tǒng)和嗅覺識別系統(tǒng)兩個生命活動的主要方面出發(fā),采用RACE技術(shù)分別克隆了跳甲的精氨酸激酶基因和一個特殊的氣味受體基因,應(yīng)用生物信息學方法對基因及表達蛋白序列進行了分析;并基于目的基因的功能區(qū)域,設(shè)計和構(gòu)建了雙鏈RNA)(dsRNA)片段;采用R

2、NA干擾技術(shù),從生物體自身功能角度出發(fā),破壞其正常能量代謝途徑或使之喪失氣味識別能力,從而達到有效防治害蟲的目的。本文也證明基于精氨酸激酶及該氣味受體的RNA干擾技術(shù)是一項潛在和有吸引力的新技術(shù),將有助于發(fā)展新的害蟲控制試劑。主要內(nèi)容如下: 1.利用RACE技術(shù)克隆獲得黃曲條跳甲精氨酸激酶基因(Phyllotreta striolataArginine kinase,PsAK),cDNA全長為1508 bp,PsAK的全長cDN

3、A已在GenBank登錄,登錄號為EU420057。PsAK的5'、3'端非編碼區(qū)分別為51 bp和386 bp,開放閱讀框(ORF)為1071 bp,ORF編碼356個氨基酸,其蛋白分子量為40.02KDa,預(yù)測的等電點為5.86。利用蛋白質(zhì)功能位點分析軟件對PsAK氨基酸序列進行分析。 結(jié)果顯示:位于PsAK氨基酸序列中的7個氨基酸CPTNLGT(271-277)是精氨酸激酶的活性中心部位序列,其中第271位的半胱氨酸(Cy

4、s)是精氨酸激酶所必需的酶活性位點。PsAK與已報道的其他昆蟲的精氨酸激酶氨基酸序列比對,相似性達66%-91%。PsAK模擬的3-D結(jié)構(gòu)非常類似Limulus polyhemusAK(epAK)的過渡狀態(tài)復合體的晶體結(jié)構(gòu),其序列一致性達到75%,在重疊的356個殘基中,RMSD的偏差僅為0.7 A。高度保守的殘基Asp62的OD2原子與Arg193的NH2的空間距離僅2.86 A,可以形成強烈的靜電相互作用,起到了穩(wěn)定分子空間構(gòu)象作用

5、。通過與LpAK空間結(jié)構(gòu)進行SuperPose疊合可預(yù)測出,在活性部位上有五個帶正電荷簇(Arg124,Arg126,Arg229,Arg280,Arg309)催化時與底物ADP結(jié)合;有七個保守的氨基酸(Gly64、Va165、Tyr68、Cys271、Ser63、Glu225、Glu314)與底物精氨酸協(xié)同結(jié)合。采用鄰接法(neighbourjoining,NJ)聚類分析結(jié)果表明,PsAK與其近緣種赤擬谷盜Tribolium cast

6、aneum的親緣關(guān)系最近,都屬于分類中經(jīng)典的第一組類型。 2.選擇PsAK的332 bp核苷酸片段(堿基790到1122,包含精氨酸激酶活性位點motif CPTNLGT)構(gòu)建dsRNA,然后配置含有不同濃度dsRNA的測試液噴灑于跳甲取食幼苗的子葉或葉片上。dsRNA喂飼分析表明,利用微量的dsRNA干擾害蟲的精氨酸激酶能夠有效地損害其生存和繁殖。RT-PCR分析表明,與對照組相比,攝食dsRNA的測試組成蟲中腸AK基因轉(zhuǎn)錄活

7、性降低,AK基因mRNA積累顯著減少。與未處理的對照組相比,AK的酶活檢測顯示出明顯的酶活性降低(P<0.05),RT-PCR與酶活性檢測提供了鏈接AK基因沉默和甲蟲滯育死亡的分子證據(jù)。本研究首次選用精氨酸激酶這個特殊基因,從生物體自身功能角度出發(fā)破壞其能量代謝途徑,從而導致害蟲死亡及生育力顯著下降。這些都表明基于精氨酸激酶的RNA干擾技術(shù)將有助于發(fā)展新的害蟲控制試劑,在害蟲防治中發(fā)揮作用。 3.從黃曲條跳甲觸角中克隆得到特殊的

8、氣味受體基因——果蠅氣味受體Or83b同源基因,命名為PsOrl,其基因編碼區(qū)為1437 bp,編碼478個氨基酸殘基.其蛋白理論分子量為54.06 KDa,預(yù)測的等電點為7.98。利用生物信息學軟件預(yù)測PsOrl具有典型的G-蛋白偶聯(lián)受體特征,有七個轉(zhuǎn)膜螺旋,第Ⅰ、Ⅲ、Ⅴ、Ⅶ螺旋軸和第Ⅱ、Ⅳ、Ⅵ螺旋軸反向平行,除轉(zhuǎn)膜螺旋Ⅳ的長度為18個氨基酸外,其它六個轉(zhuǎn)膜螺旋的長度均為23個氨基酸.但是其Nin-Cout的膜拓撲學與經(jīng)典的GPCR蛋

9、白相反。PsOrl與已經(jīng)報道的昆蟲同類嗅覺受體有較高的同源性,組成蛋白羧基端的164個氨基酸(包括3個轉(zhuǎn)膜螺旋Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ)與其他昆蟲同類嗅覺受體的同源性為82%-95%;特別是與近緣種赤擬谷盜Tribolium。castaneum 同源性高達95%,相似性達97%。這表明該區(qū)域極端保守的殘基是由于進化中的負選擇壓力而保留下來,對蛋白的結(jié)構(gòu)與功能至關(guān)重要。半定量RT-PCR研究表明,PsOrl主要在跳甲成蟲觸角中表達,在頭部(包含口器)也

10、有表達,但表達量相對較低,在成蟲其他的部位不表達,表明PsOrl可能也參與化學刺激的識別過程。 4.PsDrl基因具有高度的同源性,預(yù)示這個基因在昆蟲嗅覺中的重要作用。為了驗證PsOrl基因與Drosophila melanogaster Or83b(Dmor83b)同源基因具有相類似功能,用RNA干擾技術(shù)沉默PsDrl來檢測跳甲對不同氣味的反應(yīng)能力。PsOrl cDNA轉(zhuǎn)膜螺旋第Ⅴ到Ⅶ之間的核苷酸片段被用于構(gòu)建dsRNA?;瘜W

11、趨向行為反應(yīng)表明,基于與虛擬假設(shè)(Null hypothesis,即偏向氣殊源方向和偏離氣味源方向停留時間相等)比較的基礎(chǔ)上,野生型對引誘劑anyl isothioeyanate的氣味反應(yīng)敏感(t14=2.99,p=0.010):對拒避劑a-pinene表現(xiàn)出明顯的拒避行為(f13=3.04,p=0.009)。PsDrl嗅覺受體被沉默的跳甲與野生型相比,對引誘劑allyl isothioeyaaate(t19=0.925,p=0.367

12、)和拒避劑a-pinene(t19=0.535,p=0.599)卻沒有明顯定向行為反應(yīng),表現(xiàn)為隨機分布行為。RT-PCR分析從分子水平證明了RNAi處理后的跳甲觸角嗅覺受體表達受到了明顯抑制。 本研究進一步從產(chǎn)卵選擇性和取食選擇性兩方面研究dsRNA沉默PsOrl后,跳甲對芥菜、蘿卜、大白菜、山西白和芥藍等5種十字花科蔬菜的寄主選擇性。結(jié)果表明,在野生型對照組中,跳甲的產(chǎn)卵選擇性與取食選擇性基本一致,芥菜為其最嗜寄主,芥藍為最不

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