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文檔簡介
1、[目的]
探索基質(zhì)金屬蛋白酶-3(Matrix metalloproteinases3,MMP3)基因啟動子區(qū)多態(tài)與散發(fā)性腦動靜脈畸形(Brain arteriovenous malformation,BAVM)的遺傳易感性,并研究MMP基因啟動子區(qū)單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotidepolymorphism,SNP)的生物學功能。
[方法]
MMP3是基質(zhì)金屬蛋白酶(Matrix metal
2、loproteinases,MMP)家族中的重要成員,具有降解細胞外基質(zhì)的功能,參與血管重塑與再生,可能在BAVM的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。本課題首先通過數(shù)據(jù)庫檢索,選擇了5個在中國人群中高頻分布的潛在MMP3基因功能性SNP位點,通過病例-對照進行研究。經(jīng)檢測319例BAVM患者和333例健康對照組的血液標本,確定了與BAVM發(fā)病相關的MMP3基因啟動子區(qū)SNP位點-709A>G(rs522616)。其次,對該位點A>G突變降低BAVM
3、發(fā)生風險的分子機制進行了探索。本課題采用構建含有-709A、-709G以及位點突變的pGL3-A、pGL3-G和pGL3-mutant熒光素酶報告載體,分別轉(zhuǎn)染HEK293和HUVEC細胞,檢測熒光素酶活性,分析該SNP位點不同等位基因所導致的MMP3基因轉(zhuǎn)錄活性的不同。再通過添加含有-709A、-709G的競爭性DNA片段,分析pGL3-A受干擾后的轉(zhuǎn)錄活性,比較這兩種等位基因與轉(zhuǎn)錄因子之間結合力的強弱。然后通過生物信息學軟件確定與該
4、MMP基因啟動子區(qū)SNP結合的轉(zhuǎn)錄因子為c-myb,并通過構建其過表達熒光素酶報告載體共轉(zhuǎn)染、染色質(zhì)免疫共沉淀和凝膠遷移實驗,檢測c-myb對MMP3基因轉(zhuǎn)錄活性的影響,并在BAVM組織中進行驗證。
[結果]
通過分子流行病學調(diào)查,BAVM病例組與對照組在年齡和性別上分別匹配(p=0.062&0.945),沒有統(tǒng)計學差異。在檢索分析獲得的5個SNP位點中,MMP3基因啟動子區(qū)-709bp SNP位點rs522616
5、A>G在BAVM病例和對照組中存在顯著差異(P=0.02),攜帶rs522616 AG雜合基因型的個體與AA基因型攜帶者相比,BAVM的患病風險降低了38%(Adjusted OR=0.62,95% CI=0.44-0.87,P=0.006)。轉(zhuǎn)錄活性實驗證實,在HEK293細胞中,G等位型的熒光素酶活性較A相比顯著下降了2.67倍(P<0.01);在HUVEC細胞中,G等位型也下降了5.89倍(P<0.05)。在競爭實驗中,A比G競爭
6、片段可以更大程度降低pGL3-A轉(zhuǎn)錄的熒光素酶活性(Aportion vs G portion=0.503-fold vs0.756-fold,P=0.01)。提示A>G的突變降低了MMP3基因啟動子區(qū)的轉(zhuǎn)錄活性以及與轉(zhuǎn)錄因子的結合力。通過生物信息學檢測,發(fā)現(xiàn)在MMP3基因啟動子區(qū)SNP rs522616周圍6個堿基TTCAAT是轉(zhuǎn)錄因子c-myb的結合位點,在細胞水平上過表達c-myb,可以使得pGL3-A的熒光素酶活性在HEK293
7、及HUVEC細胞中分別提高了1.7倍和1.2倍(P<0.05),而不能明顯提高pGL-G的轉(zhuǎn)錄活性。染色質(zhì)免疫共沉淀和凝膠遷移實驗證實了在細胞系以及BAVM組織中,轉(zhuǎn)錄因子c-myb與包含-709A等位型的MMP啟動子區(qū)域結合更為緊密。
[結論]
本研究首次提出MMP3基因啟動子區(qū)SNP-709 A>G(rs522616)可能可以降低BAVM的發(fā)病風險,該保護作用的機制在于-709 A>G的突變能減弱MMP3基因啟動
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