致GBS空腸彎曲菌全基因組序列突變基因的初步分析.pdf

1、目的：從基因突變的角度出發(fā)，選擇三株本地區(qū)的具有致GBS致病性的空腸彎曲菌菌株，針對(duì)不同的基因片段，與NCTC11168序列比對(duì)分析，尋找基因突變和變異與致病性的關(guān)系，及菌株的基因地域特點(diǎn)。
　　 方法：⑴選取分離自華北地區(qū)AMAN型GBS病人的C.jejuni菌株。血清分型為pennerO：19型，pennerO：2型，pennerO：5型。⑵應(yīng)用Sequence Alignment軟件將pennerO：2、pennerO：5

2、、pennerO：19的全基因組序列與Genbank中NCTC11168序列比較，找出突變堿基。⑶查閱文獻(xiàn)中推測(cè)和已經(jīng)確定的突變基因，找到此基因片段分別在pennerO：2、pennerO：5、pennerO：19中與NCTC11168序列比較的突變堿基。⑶分析菌株差異及基因突變的意義。
　　 結(jié)果：①與NCTC11168全基因組序列相比，lulei株有13183個(gè)堿基突變，qiaoyuntao株有3624個(gè)堿基突變，zhanx

3、ing株有16505個(gè)堿基突變。②從文獻(xiàn)中共找到137個(gè)推測(cè)的和已經(jīng)確定的致GBS的突變基因片段。lulei株、qiaoyuntao株、zhanxing株在相同堿基位點(diǎn)核苷酸均突變的基因片段有22個(gè)，三株菌中任意兩株菌在相同的堿基位點(diǎn)產(chǎn)生核苷酸突變的基因片段共有50個(gè)，在同一堿基位點(diǎn)三株菌無相同的核苷酸突變的基因片段共40個(gè)，三株菌均無核苷酸突變的基因片段有25個(gè)。③文獻(xiàn)中已經(jīng)確定的并經(jīng)實(shí)驗(yàn)證實(shí)致GBS突變基因有g(shù)alE、neuB1、c

4、st-Ⅱ和waaF，經(jīng)排序后推測(cè)較有意義的突變基因有20個(gè)，有突變意義的基因50個(gè)，突變意義較小的突變基因有40個(gè)，無突變意義的基因有23個(gè)。
　　 結(jié)論：從文獻(xiàn)中共找到137個(gè)推測(cè)的和已經(jīng)確定的致GBS的突變基因片段。文獻(xiàn)中已經(jīng)確定的并經(jīng)實(shí)驗(yàn)證實(shí)致GBS突變基因有g(shù)alE、neuB1、cst-Ⅱ和waaF，經(jīng)排序后推測(cè)較有意義的突變基因有20個(gè)，有突變意義的基因50個(gè)，突變意義較小的突變基因有40個(gè)，無突變意義的有23個(gè)。而n

5、euB1、cst-Ⅱ等基因在lulei株、qiaoyuntao株、zhanxing株均無突變，原因可能是本地致GBS的菌株無neuB1、cst-Ⅱ等的突變，考慮為本地菌株的特點(diǎn)，仍需要更多的本地菌株來驗(yàn)證；或者空腸彎曲菌致GBS可能不是單一基因致病，而是多個(gè)基因共同作用的結(jié)果。這種出現(xiàn)在本地菌株間的相同突變可能使所編碼蛋白發(fā)生有意義的改變，影響到蛋白功能，成為本地菌株高致病性以及華北地區(qū)GBS高發(fā)的分子生物學(xué)基礎(chǔ)?？傊狙芯恐械娜曛翧