湖北海棠SRAP體系建立及其遺傳多樣性研究.pdf

1、本研究首先建立了湖北海棠SRAP標記反應體系，結果表明湖北海棠SRAP-PCR最佳反應體系為：Mg<'2+>2.5mmol/L，Taq酶1.5u，dNTP0.3mmol/L，引物0.3umol/L，Bufferl×，DNA模板30ng，反應總體積25uL。用優(yōu)化的體系對33份湖北海棠樣本進行了擴增分析，所用引物都能擴增出清晰的譜帶，且多態(tài)性很強。因此，SRAP的引物組合在湖北海棠上適應性很強，SRAP適用于北海棠的遺傳多樣性研究，也適用

2、于其起源與分類的研究。 從36對引物組合中選擇條帶清晰、多態(tài)性好的引物12對對供試33個基因型進行擴增，片段大小在300-2000bp，每對引物組合產生4-13條譜帶，多態(tài)性條帶占總帶數的91.225％。用1個引物不能將所有供試材料區(qū)分出來。33個基因型的相似系數在0.5104～0.9271，表明湖北海棠具有遺傳多樣性。 應用UPGMA法進行聚類分析表明，在L=0.69時，33份供試材料分為5個組，在L=0.63時，分為

3、3個組；主坐標分析顯示，33種供試材料分為5個組，除一個材料外，其余材料分組與聚類分析L=0.69時分組情況相同。在聚類的同一組里，有不同來源的湖北海棠樣品，而在同一來源地的湖北海棠又有的不能聚在同一組，用主坐標分析有基本相同的結果，表明湖北海棠遺傳多樣性與地域性沒有對應關系，類似于居群內遺傳變異規(guī)律。平邑甜茶源自山東，卻與源自神農架的其它類型聚在一起，可能是人為傳播的結果。 此外，供試材料雖有遺傳多樣性，但部分相似系數還是比較