腎癌患者腎癌組織microRNA差異表達(dá)及可能的臨床意義.pdf

1、中山大學(xué)博士學(xué)位論文腎癌患者腎癌組織microRNA差異表達(dá)及可能的臨床意義姓名：李明申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：內(nèi)科學(xué)指導(dǎo)教師：余學(xué)清20090601中山大學(xué)博士學(xué)位論文 腎癌患者腎癌組織m i c r o R N A 差異表達(dá)及可能的臨床意義解它們之間的相互關(guān)系，這種方法不能全面地了解機(jī)體的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。并且都是采用芯片的方法進(jìn)行表達(dá)譜分析，而芯片具有假陽性高，不能檢測低豐度表達(dá)的基因和m i R N A s ，不能鑒別新的m i R

2、N A s 等缺陷，新一代測序技術(shù)因其高通量，高精確性可以彌補(bǔ)這一不足。為了全面系統(tǒng)地了解腎癌患者腎癌組織的m i R N A 表達(dá)差異及可能的臨床意義，我們擬以腎透明細(xì)胞癌這一最多見的腎癌病理類型為研究對象，采用新一代測序技術(shù)S o l e x a 平臺，通過同時對m i R N A s 及基因的表達(dá)譜進(jìn)行大規(guī)模比較基因組學(xué)研究，尋找腎癌中差異表達(dá)的m i R N A 和其相應(yīng)的靶基因，從分子生物學(xué)水平上揭示m i R N A s 參

3、與癌癥的可能生物機(jī)理。并且運(yùn)用比較基因組學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)的手段，了解m i R N A s 與靶基因作用的詳細(xì)機(jī)制，為腎癌的診斷及治療提供可靠翔實的分子生物學(xué)基礎(chǔ)。我們共選取六名腎透明細(xì)胞癌患者，其中性別和年齡相匹配的男女患者各三名，分別對他們的腎癌組織和癌旁正常組織進(jìn)行m i R N A 和基因的表達(dá)譜分析。我們的研究共檢測到腎組織中有5 0 0 多個m i R N A 的表達(dá)，其中2 0 0 個m i R N A的表達(dá)量較高。在所有腎

4、癌患者的腎癌組織中約有6 4 個m i R N A 的表達(dá)差異，其中下調(diào)表達(dá)的4 0 個，上調(diào)表達(dá)的2 4 個。我們將含有相同S e e d ( m i R N A 第2 ．8位) 的m i R N A 聚類為同一家族，發(fā)現(xiàn)在男性患者中，1 8 個m i R N A 家族在正常組織和癌組織中表達(dá)存在顯著差異；在女性患者中，8 個m i R N A 家族在正常組織和癌組織中表達(dá)存在顯著差異。同時，我們還發(fā)現(xiàn)了1 0 0 多個新的候選m i

5、 R N A 。在基因表達(dá)譜分析中，共檢測到1 4 0 0 0 個基因，其中9 4 0 0 個基因的表達(dá)豐度較高。腎癌組織中以下調(diào)表達(dá)的基因為主。男女患者分別都有基因表達(dá)的差異；在所有患者中都有差異表達(dá)的基因共有2 8 個，其中下調(diào)表達(dá)的基因2 6 個，上調(diào)表達(dá)的基因2 個。將這些基因進(jìn)行功能分析，發(fā)現(xiàn)在下調(diào)表達(dá)的基因中有7 個與代謝和信號通路相關(guān)，分別參與P P A R 信號通路和脂肪酸和氨基酸等代謝途徑。同時，我們采用系統(tǒng)生物學(xué)的方