胰腺導(dǎo)管腺癌lncRNAs差異表達(dá)譜的篩選及功能分析.pdf

1、復(fù)旦大學(xué)博士學(xué)位論文胰腺導(dǎo)管腺癌lncRNAs差異表達(dá)譜的篩選及功能分析姓名：童漢興申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：外科學(xué)指導(dǎo)老師：靳大勇教授導(dǎo)師組成員：樓文暉教授王單松教授陸維祺教授20140402中文摘要第一部分胰腺導(dǎo)管腺癌IncRNAs差異表達(dá)譜的篩選及驗(yàn)證【背景】胰腺導(dǎo)管腺癌是一種難治性惡性腫瘤。早期缺乏特異性癥狀和體征，一旦出現(xiàn)癥狀和體征，腫瘤多數(shù)已進(jìn)展至晚期。另外其復(fù)雜的解剖特點(diǎn)和獨(dú)特嗜神經(jīng)特性也決定了該腫瘤根治性手術(shù)切除困難、切除

2、率較低，切即使手術(shù)切除，文獻(xiàn)報(bào)道其5年生存率也不足5％。胰腺癌對(duì)放化療不敏感，一旦復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移，更缺乏有效的治療手段。因此為了改善胰腺癌的預(yù)后，亟待開發(fā)胰腺癌早期診斷的分子標(biāo)記物和治療靶點(diǎn)。雖然近20年來，關(guān)于胰腺癌的遺傳分子研究取得很大進(jìn)展，但并未開發(fā)出有效的診斷標(biāo)記物和治療靶點(diǎn)。近年來研究發(fā)現(xiàn)非編碼RNA廣泛參與正常生理及病理生理過程的調(diào)控，和腫瘤的關(guān)系密切。其中長鏈非編碼RNA(10ngnoncodingRNA，lncRNA)在惡性腫

3、瘤中的研究取得很多令人鼓舞的的進(jìn)展，該類研究也極大的豐富了表觀遺傳研究的內(nèi)容。lncRNAs在胰腺癌中的研究剛剛起步。因此深入研究lncRNAs在胰腺癌發(fā)生發(fā)展中的作用，將有助于深入認(rèn)識(shí)胰腺癌發(fā)生發(fā)展的機(jī)制，為改善胰腺癌診治水平開辟新思路?！灸康摹垦芯縧ncRNAs在胰腺癌組織及癌旁組織中的表達(dá)特征，預(yù)測差異表達(dá)lncRNAs在胰腺癌組織中基因異常表達(dá)的調(diào)控作用?！痉椒ā坎捎肏umanLncRNAArrayv20(8x60K，Array

4、star)芯片對(duì)6對(duì)胰腺癌組織及癌旁組織標(biāo)本中的轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行高通量篩查，確定胰腺癌中的lncRNAs和rnRNAs差異表達(dá)譜。然后采用qPCR在61例胰腺導(dǎo)管腺癌、20例胰腺漿液性囊腺瘤、14例實(shí)性假乳頭狀瘤、10例神經(jīng)內(nèi)分泌瘤及12例十二指腸乳頭腺癌的癌組織和癌旁組織中對(duì)5個(gè)差異表達(dá)的lncRNAs，AC090110131、CXCR2P1、PPY2、HOXAll86、DKFZp434J0226進(jìn)行驗(yàn)證。采用GO、Pathway及編碼非編

5、碼基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)等生物信息學(xué)方法對(duì)差異表達(dá)mRNAs的功能及差異表達(dá)lncRNAs對(duì)胰腺癌組織中基因異常表達(dá)的調(diào)控作用進(jìn)行分析，并為進(jìn)一步的研究奠定基礎(chǔ)?！窘Y(jié)果】芯片雜交數(shù)據(jù)分析顯示，在6對(duì)胰腺癌組織和癌旁組織之間，表達(dá)差異倍數(shù)2，p≤O05的IncRNAs有291個(gè)，其中上調(diào)的53個(gè)，下調(diào)的76個(gè)。聚類分析顯示，291個(gè)差異表達(dá)的IncRNAs能夠區(qū)分癌組織和癌旁組織。其中91個(gè)lncRNAs在6對(duì)標(biāo)本中的變化與總體結(jié)果一致，其中34