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文檔簡介
1、綿羊支原體肺炎是一種能引發(fā)綿羊以咳嗽、喘氣、漸進性消瘦及肺間質(zhì)的增生性炎癥為特征的慢性呼吸道疾病,對養(yǎng)羊業(yè)危害嚴(yán)重。短的上腭、肺及鼻咽上皮克隆基因1(short palate,lung and nasal epithelium clone1,SPLUNC1)是一種在呼吸道上皮高表達的蛋白質(zhì)分子,參與了宿主防御活動,具有抗菌和抗炎的功能,同時還能抑制肺炎支原體生長。本研究通過克隆巴什拜羊與湖羊的SPLUNC1基因cDNA全長序列,對其進行
2、生物信息學(xué)分析,通過真核表達巴什拜羊與湖羊的SPLUNC1基因,研究重組SPLUNC1蛋白對綿羊肺炎支原體的作用,驗證其生物活性,為下一步研究綿羊SPLUNC1蛋白的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。
本研究主要內(nèi)容包括:⑴巴什拜羊與湖羊的SPLUNC1基因全長cDNA的擴增:根據(jù)GenBank上已報道的牛的SPLUNC1基因序列,設(shè)計引物,使用RACE技術(shù)分別克隆巴什拜羊與湖羊的SPLUNC1基因的3’端序列和5’端序列,并測序、拼接獲得
3、巴什拜羊與湖羊的SPLUNC1基因的全長cDNA序列。⑵巴什拜羊與湖羊的SPLUNC1基因全長cDNA的生物信息學(xué)分析:利用生物信息學(xué)軟件及在線分析工具對獲得的巴什拜羊與湖羊SPLUNC1基因全長cDNA序列進行核酸及其編碼蛋白信號肽、亞細(xì)胞定位、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)、進化樹等生物信息學(xué)分析。⑶巴什拜羊與湖羊的SPLUNC1基因的克隆與表達:使用PCR方法擴增出巴什拜羊與湖羊的SPLUNC1基因的開放閱讀框序列,并將該序列連接至pPIC9
4、K真核表達載體,構(gòu)建pPIC9K-SPLUNC1表達質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化至巴斯德畢赤酵母GS115感受態(tài)細(xì)胞中進行誘導(dǎo)表達,優(yōu)化誘導(dǎo)表達條件并對表達產(chǎn)物進行 SDS-PAGE和 Western Blotting分析鑒定。⑷重組巴什拜羊與湖羊的SPLUNC1蛋白的純化與生物活性研究:利用Ni柱純化方法分別對重組巴什拜羊與湖羊 SPLUNC1蛋白進行純化,將純化的蛋白作用于綿羊肺炎支原體,使用熒光實時定量法檢測純化蛋白對綿羊肺炎支原體的作用。⑸巴什拜
5、羊、湖羊SPLUNC1基因全長分別為1095bp和1091bp,核苷酸相似性為99%。⑹巴什拜羊、湖羊SPLUNC1的核苷酸序列有五處核苷酸堿基差異,但是二者的開放閱讀框均為768bp,編碼氨基酸相同,均為255個氨基酸。SPLUNC1蛋白質(zhì)的分子量為26.53 KD,理論等電點為5.07。SPLUNC1蛋白N端存在信號肽,亞細(xì)胞定位在細(xì)胞外。SPLUNC1蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)主要為α螺旋和無規(guī)則卷曲。該蛋白由4股反平行的肽段形成的β折疊片
6、和2個α螺旋組成的桶型結(jié)構(gòu)域組成。系統(tǒng)發(fā)育樹分析結(jié)果說明,SPLUNC1蛋白與山羊首先聚為一類,后與牛聚為一類,這與動物學(xué)分類結(jié)果一致。⑺在巴斯德畢赤酵母 GS115中成功表達巴什拜羊與湖羊重組SPLUNC1蛋白,經(jīng)SDS-PAGE檢測發(fā)現(xiàn),蛋白的分子量均為25.53kD,且在甲醇誘導(dǎo)72h表達的蛋白含量較高,經(jīng)Western Blotting檢測證實表達蛋白為目的蛋白。⑻SDS-PAGE檢測純化的重組蛋白,結(jié)果顯示為單一的條帶,且分子
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