人類骨肉瘤血清診斷標(biāo)志物的血清蛋白質(zhì)組學(xué)研究.pdf

1、第二軍醫(yī)大學(xué)博士學(xué)位論文人類骨肉瘤血清診斷標(biāo)志物的血清蛋白質(zhì)組學(xué)研究姓名：李國東申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：外科學(xué)（骨外）指導(dǎo)教師：蔡鄭東20090501第二軍醫(yī)大學(xué)博士研究生畢業(yè)論文人類骨肉瘤血清診斷標(biāo)志物的血清蛋白質(zhì)組學(xué)研究等應(yīng)用SELDITOF—MS技術(shù)比較了29例骨肉瘤患者和20例年齡、性別相配的骨軟骨瘤患者的血漿蛋白組。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)SAA蛋白在骨肉瘤患者的血漿中表達(dá)明顯高于骨軟骨瘤組，試驗(yàn)結(jié)果得到了Westernblotting實(shí)驗(yàn)的

2、有力驗(yàn)證。國內(nèi)沈靖南等采用了雙向熒光差異凝膠電泳(2DFluorescenceDifferenceGelE1ectrophoresis，2DDIGE)和基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜(Matrix—AssistedLaserDesorption／IonizationTimeofFlightMassSpectrometry，MALDI—TOF一髑)研究了人類骨肉瘤患者和正常健康成人的血清蛋白質(zhì)組差異，進(jìn)一步的驗(yàn)證試驗(yàn)證實(shí)SAA蛋白在骨肉

3、瘤患者血清中的表達(dá)水平明顯高于健康人。然而，在腫瘤生物標(biāo)志物的探索方面還存在很多技術(shù)限制。比如，對于前列腺癌，幾個不同研究機(jī)構(gòu)的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)的腫瘤標(biāo)志物都不相同。難以證實(shí)腫瘤特異性標(biāo)志物是臨床應(yīng)用質(zhì)譜分析和基因芯片數(shù)據(jù)的最大障礙。一個有望解決上訴問題的策略就是找到一個能將基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)果統(tǒng)一起來，找到兩個組學(xué)共同差異的分析平臺。Deng等學(xué)者最近報(bào)道了一個新的統(tǒng)計(jì)學(xué)計(jì)算方法1ink—test。研究者使用這種計(jì)算法從基因芯片和SE

4、LDI質(zhì)譜兩個實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中篩查到了前列腺癌的候選特異性腫瘤標(biāo)志物。為了從兩個組學(xué)數(shù)據(jù)集中篩查到前列腺癌的腫瘤標(biāo)志物，Linktest通過引入SWISSPROT數(shù)據(jù)庫中全部人類蛋白序列的質(zhì)譜分布來確定基因標(biāo)志物(基因組學(xué))和特定質(zhì)譜標(biāo)志物(蛋自質(zhì)組學(xué))之間聯(lián)系的重要性水準(zhǔn)。交叉驗(yàn)證結(jié)果顯示這種所得到的腫瘤標(biāo)志物具有腫瘤特異性。這種多平臺分析方法的優(yōu)勢在于候選腫瘤標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和證實(shí)是采用基于miCrA和蛋白質(zhì)產(chǎn)物的兩種高通量的分析方法(基因芯