水稻米香基因標(biāo)簽標(biāo)記的開發(fā)與利用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、香味是稻米的重要品質(zhì)特性之一。在組成香味的100多種化合物中,2-乙?;?1-吡咯啉(2AP)是最主要的成分。以往研究表明:位于水稻第8號染色體的一對隱性基因fgr控制2AP的合成,并在分子標(biāo)記L02與L06之間獲得了三個分別編碼真核類碳酸酐酶(CAH)、3-甲基乙酰輔酶A羧化酶β鏈(MCCC2)以及甜菜堿脫氫酶(BADH2)的候選基因。 本研究通過篩選BAC庫,克隆香稻品種“蘇御糯”、非香品種“南京11”的三個候選基因并進行測

2、序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在Badh2基因序列上存在著香、非香之間的差異,尤其是外顯子7上8bp的缺失和3bp的突變將引起編碼蛋白的提前終止。在此差異區(qū)域兩端發(fā)展分子標(biāo)記,對24個香稻品種和10個非香品種進行等位性檢測。在24個香稻品種中,發(fā)現(xiàn)只有部分香稻品種存在相同的突變,其余的與非香品種完全相同。為此,我們對外顯子7正常的兩個香稻品種“武香粳9號”和“香粳111”進行全基因測序。所獲序列與香稻品種“蘇御糯”和非香品種“南京11”序列比對后,發(fā)現(xiàn)在

3、外顯子1上存在著7bp的缺失。在該差異區(qū)域兩側(cè)發(fā)展新的分子標(biāo)記,對24個香稻品種和10個非香品種的外顯子1進行序列分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn):香稻品種的米香基因fgr存在二種變異類型,即在外顯子7上完整的則在外顯子1上有7bp的缺失;或者在外顯子1上完整的則在外顯子7上有8bp的缺失和3bp的突變。對非香品種來說,在外顯子7和外顯子1上均完整。由此可見,控制米香性狀的等位基因至少有兩個。利用這兩個變異區(qū)域所設(shè)計的分子標(biāo)記可在分離群體中篩選香、非香或

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