我國水稻主栽品種SSR多樣性比較及水稻紋枯病抗性遺傳分析.pdf

1、本研究應(yīng)用SSR分子標(biāo)記來分析我國水稻主栽品種的遺傳多樣性,并對水稻紋枯病抗性基因進(jìn)行了初步定位.主要研究結(jié)果如下:1.采用40個(gè)SSR標(biāo)記,比較分析了151份上世紀(jì)50年代和近10年我國常規(guī)稻主栽品種的遺傳差異,發(fā)現(xiàn)有39個(gè)標(biāo)記具有多態(tài)性,多態(tài)位點(diǎn)共檢測到213個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)2～11個(gè),平均5.5個(gè);平均Nei基因多樣性指數(shù)(He)為0.649,范圍在0.309(RM174)～0.869(RM418)間.秈粳亞種間SSR多樣性差

2、異明顯,秈稻平均等位基因數(shù)(Na)和Nei基因多樣性指數(shù)(Na=4.4,He=0.458)均高于粳稻品種(Na=4.0,He=0.395).比較78份50年代與73份近10年水稻主栽品種的遺傳多樣性,秈、粳亞種表現(xiàn)出相近的變化趨勢,即Nei多樣性指數(shù)和等位基因數(shù)50年代主栽品種高于近10年的.雖然Nei基因多樣性指數(shù)的變化并不顯著(秈稻:z=1.471,P=0.141;粳稻:z=1.932,P=0.053),但等位基因數(shù)目的變化達(dá)到顯著

3、值(秈稻:z=2.677,P=0.007;粳稻:z=3.441,P=0.001).AMOVA分析表明,遺傳變異絕大部分存在于兩時(shí)期內(nèi),盡管時(shí)期間平均貢獻(xiàn)的遺傳變異僅占1.9﹪,但仍然達(dá)到5﹪的顯著水平;秈、粳亞種兩時(shí)期間平均貢獻(xiàn)的遺傳變異高于整個(gè)分析樣本,分別為5.0﹪和8.2﹪;秈、粳亞種不同位點(diǎn)的遺傳分化程度也各不相同,秈稻和粳稻品種分別有13個(gè)和11個(gè)SSR位點(diǎn)的等位基因在兩時(shí)期間差異顯著,而其余位點(diǎn)的遺傳變異則是因時(shí)期內(nèi)品種間的

4、差而引起的.2.利用174份源于組合Maybelle/白葉秋的加倍單倍體(DH)群體,連續(xù)兩年進(jìn)行4重復(fù)的隨機(jī)區(qū)組田間實(shí)驗(yàn),運(yùn)用改進(jìn)的紋枯病人工接種鑒定方法,調(diào)查其紋枯病病級,結(jié)合該群體構(gòu)建的分子標(biāo)記連鎖圖譜,運(yùn)用區(qū)間作圖法對抗紋枯病QTL進(jìn)行了定位.兩年在第1染色體的相鄰區(qū)間RM583～RM575(2005年)和RM575～RM580(2006年)上各檢測到了一個(gè)抗紋枯病OTL,貢獻(xiàn)率分別為7.26﹪(2005年)和6.99﹪(200

5、6年),第1染色體上檢測到的抗紋枯病OTL來源于白葉秋.兩年在第5染色體上均檢測到一個(gè)QTL,位于相同的區(qū)間RM274～RM178的不同位置,貢獻(xiàn)率分別是6.36﹪(2005年)和12.16﹪(2006年),而第5染色體上檢測到的抗性QTL來自另一親本Maybelle. 根據(jù)上述研究結(jié)果,表明近10年我國常規(guī)稻主栽品種丟失了一部分等位基因,水稻育種仍應(yīng)加強(qiáng)更廣泛的種質(zhì)親本的選擇;定位的紋枯病抗性QTLs對抗紋枯病分子標(biāo)記輔助育種