結(jié)核病易感基因SNPs多態(tài)性與結(jié)核病的關(guān)聯(lián)及其與傳統(tǒng)因素交互作用研究.pdf

1、背景：全球約三分之一的人群感染結(jié)核分枝桿菌，但僅約5％-10%的感染者發(fā)展為不同類(lèi)型的臨床結(jié)核病(80%以上為肺結(jié)核)，目前普遍認(rèn)為結(jié)核分枝桿菌的感染、結(jié)核病的發(fā)生和轉(zhuǎn)歸與環(huán)境因素及宿主遺傳因素密切相關(guān)，且這些因素之間存在復(fù)雜的交互作用，但目前關(guān)于兩者在結(jié)核病發(fā)生中的交互作用研究報(bào)道極少。同時(shí)結(jié)核病相關(guān)環(huán)境因素和宿主遺傳因素存在明顯地域和人群差異性，因此，以不同地區(qū)人群為研究對(duì)象，進(jìn)一步闡明宿主易感性和環(huán)境因素在結(jié)核桿菌感染和結(jié)核病發(fā)生

2、中的交互作用，有助于我們深入了解結(jié)核病發(fā)生、發(fā)展機(jī)制，為預(yù)防控制該病的發(fā)生和流行提供科學(xué)依據(jù)。
　　 由于機(jī)體對(duì)結(jié)核桿菌主要是有菌細(xì)胞免疫，巨噬細(xì)胞是對(duì)結(jié)核桿菌感染免疫、產(chǎn)生組織學(xué)應(yīng)答最主要的效應(yīng)細(xì)胞類(lèi)型，而SP110基因、VDR基因和NRAMP1基因均可影響巨噬細(xì)胞功能、活性，從而影響結(jié)核分支桿菌在巨噬細(xì)胞中的存活、生長(zhǎng)及感染后的轉(zhuǎn)歸等。大量流行病學(xué)研究證實(shí)SP110基因、VDR基因以及NRAMP1基因多態(tài)性與結(jié)核病易感性密切

3、相關(guān)，但不同研究及系統(tǒng)評(píng)價(jià)發(fā)現(xiàn)這些聯(lián)系是不恒定，甚至相互矛盾，其主要原因可能與選擇的研究對(duì)象的樣本量、種族、地域等因素有關(guān)。重慶地區(qū)地處我國(guó)西部，屬于結(jié)核病高發(fā)地區(qū)，因此本研究選擇重慶人群，探討對(duì)巨噬細(xì)胞功能影響明顯的SP110、VDR和NRAMP1基因的多態(tài)性與肺結(jié)核易感性的關(guān)系及基因間、基因與傳統(tǒng)環(huán)境間的交互作用，為理解結(jié)核病發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制等提供科學(xué)依據(jù)。
　　 第一章VDR基因多態(tài)性與結(jié)核病易感性的Meta分析

4、>　　 研究方法：嚴(yán)格按照Cochrane Reviewer's Handbook指導(dǎo)，通過(guò)文獻(xiàn)檢索、文獻(xiàn)追溯以及手工檢索等方法，廣泛全面收集VDR基因多態(tài)性與結(jié)核病易感性的相關(guān)性的研究，選擇符合納入(排除)標(biāo)準(zhǔn)的病例對(duì)照研究進(jìn)行文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià)和數(shù)據(jù)提取，采用RevMan5.0軟件進(jìn)行異質(zhì)性檢驗(yàn)。
　　 主要結(jié)果與結(jié)論：(1)共17篇病例對(duì)照研究納入分析，繪制漏斗圖并采用Egger法對(duì)發(fā)表結(jié)果是否偏倚進(jìn)行評(píng)估，漏斗圖對(duì)稱(chēng)，未見(jiàn)明

5、顯發(fā)表偏倚(t=-0.39，P=0.71)。(2)VDR基因FokI-f(OR95%CL為1.12，1.02～1.23)和ff基因型(OR95%CL為1.12，1.10～1.77)與結(jié)核病易感性相關(guān)。(3)未顯示VDR基因TaqI、ApaI和BsmI多態(tài)性與結(jié)核病易感性存在相關(guān)性，OR95%CI均在跨過(guò)1。
　　 第二章SP110等結(jié)核病易感基因SNPs與環(huán)境因素的關(guān)聯(lián)及交互作用
　　 研究方法：選擇重慶市結(jié)核病防治所、

6、沙坪壩區(qū)疾控中心確診的肺結(jié)核患者(排除伴其他傳染病和糖尿病、腫瘤患者等免疫功能低下者的患者)共198例作為病例組；以年齡和性別為匹配因素，從三甲醫(yī)院獻(xiàn)血中心、體檢中心收集健康成人選擇195人作為對(duì)照組。病例組和對(duì)照組成員均面對(duì)面詢(xún)問(wèn)填寫(xiě)調(diào)查表，并采集靜脈血5ml(檸檬酸鈉抗凝)，采用全血基因組提取試劑盒提取全血基因組DNA，采用高分辨熔解曲線(xiàn)分析技術(shù)(high-resolution melting analysis，HRM)進(jìn)行SP11

7、0(rs2114592、rs722555、rs1135791)、VDR(TaqI、FokI)和NRAMP1(3'UTR、D543N、INT4)基因SNPs多態(tài)性檢測(cè)。通過(guò)單因素、多因素logistic回歸分析，計(jì)算OR、OR95%CI及卡方值、P值等指標(biāo)，比較病例組和對(duì)照組中基因型分布差異，并進(jìn)行基因與環(huán)境因素的交互作用分析。
　　 主要結(jié)果與結(jié)論：(1)兩組的年齡、性別均無(wú)顯著差異，兩組人群具有良好的可比性；(2)單因素分析結(jié)

8、果顯示：人居平均面積大、人均年收入高是結(jié)核病發(fā)生的保護(hù)因素(OR及OR95%Cl值均小于1)，而周?chē)嘶冀Y(jié)核病、吸煙、居住擁擠、居室不通風(fēng)、工作強(qiáng)度大是危險(xiǎn)因素(OR及OR95%Cl均大于1)。(3)病例組中SP110基因rs722555基因型G/G、rs1135791基因型C/T和INT4的G/C、3'UTR的TGTG/缺失和D543N基因型G/A以及VDR基因Fok I-ff基因型分布頻率顯著高于對(duì)照組(P<0.05)，且以各位點(diǎn)的

9、野生型為參照的OR及OR95%CI值均大于1，提示攜帶這些突變類(lèi)型是結(jié)核病發(fā)生的可能危險(xiǎn)因素。(4)多因素logistic回歸分析顯示：居住擁擠、吸煙、VDR基因Fok I-ff、NRAMP1基因INT4基因型G/C、D543N基因型G/A和SP110基因rs722555基因型G/G進(jìn)入回歸模型，其OR及OR95%CI與這些因素單獨(dú)存在時(shí)存在明顯差異，提示這些因素在結(jié)核病發(fā)生中存在一定交互作用。
　　 本研究進(jìn)一步證實(shí)了宿主遺傳