黃瓜第1,3-5染色體分子細(xì)胞遺傳圖譜的構(gòu)建及黃瓜屬rDNA定位比較分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、黃瓜(Cucumis sativus,2n=14)屬于葫蘆科(Cucurbitaceae)黃瓜屬(Cucumis),是世界上十種最主要的蔬菜作物之一,同時也是植物性別決定和維管束研究的模式生物。目前,黃瓜的基因組序列精細(xì)圖譜的繪制已基本完成,將物理圖譜和遺傳圖譜整合,構(gòu)建分子細(xì)胞遺傳學(xué)圖譜,對于基因組序列的正確組裝,遺傳圖上某些遺傳標(biāo)記間的次序、連鎖群的方向和序列拼接時出現(xiàn)的錯誤次序進(jìn)行校正具有重要意義。細(xì)胞遺傳學(xué)圖譜的構(gòu)建是物理作圖領(lǐng)

2、域的前沿,然而對大多數(shù)物種來說,構(gòu)建細(xì)胞遺傳圖譜還是一項非常有挑戰(zhàn)的工作。本研究以黃瓜測序品種自交系9930為材料,利用熒光原位雜交技術(shù)獲得黃瓜已組裝序列在每條染色體上的分布情況,構(gòu)建黃瓜每條染色體的高分辨率的分子細(xì)胞遺傳圖譜,為黃瓜近緣種間的比較基因組研究奠定基礎(chǔ),同時在比較近緣種基因組間的同線性、揭示基因組間的進(jìn)化關(guān)系方面也具有重要意義。同時我們利用FISH技術(shù),選取了黃瓜屬15個物種進(jìn)行了45S rDNA,5S rDNA定位,以期

3、了解黃瓜屬物種rDNA分布的主要情況及對它們的親緣關(guān)系進(jìn)行更深入的研究。主要研究結(jié)果如下:
 ?。?)根據(jù)基因組組裝圖譜,篩選克隆,利用雙色FISH技術(shù)在中期染色體上確定相鄰克隆的順序,在這個結(jié)果的基礎(chǔ)上,探針的混合物同著絲粒特有序列TypeⅢ雜交到粗線期染色體上,顯示出間隔的紅綠信號,分析而得到分子細(xì)胞遺傳圖譜。
  (2)結(jié)合前人的研究結(jié)果,繪制了黃瓜7條染色體的遺傳圖譜、細(xì)胞遺傳學(xué)圖譜、基因組序列組裝圖譜的示意圖。文中

4、采用相對圖譜距離(RMP)直觀比較三張圖譜。結(jié)果顯示:三張圖譜中大部分位點的RMP值顯示出了很好的一致性;第2號染色體的遺傳圖譜上克隆2-10,2-11順序與物理定位不一致;第5號染色體遺傳圖譜上的3個克隆的位置與物理位置相差較大;第4號染色體的基因組序列組裝圖譜上4-4,5,6,7四個克隆的位置與物理位置相差較大;第5,7號染色體的序列組裝圖譜上克隆順序存在錯誤。
 ?。?)所研究的物種中45S rDNA位點數(shù)目為1-5對,主要

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