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1、利用結(jié)構(gòu)建模方法對(duì)釀酒酵母中糖代謝的動(dòng)力學(xué)性能進(jìn)行研究。這一方法基于糖代謝的動(dòng)力學(xué)結(jié)構(gòu)并與試驗(yàn)所觀察的具體濃度和流速值有關(guān)。在研究中,我們首先考慮在釀酒酵母中糖代謝路徑的結(jié)構(gòu),而后進(jìn)行動(dòng)力學(xué)分析。結(jié)果表明,PFK反應(yīng)在糖代謝過(guò)程中扮演了極其關(guān)鍵的角色,而底物F6P和抑制劑ATP所對(duì)應(yīng)的飽和參數(shù)決定了出現(xiàn)復(fù)雜動(dòng)力學(xué)行為的區(qū)域。另外,PK反應(yīng)也被證明能在一定程度上誘發(fā)振蕩的出現(xiàn)。 而后,我們又通過(guò)合成基因振蕩器模型對(duì)糖代謝過(guò)程中振蕩
2、的同步進(jìn)行了研究。首先,AcP,AcCoA,HOAc被分別視為可能的同步劑一一討論。結(jié)果表明,通過(guò)數(shù)值模擬后,AcCoA仍無(wú)法使振蕩同步,而AcP對(duì)同步的實(shí)現(xiàn)則存在很強(qiáng)的作用。而對(duì)于HOAc,通過(guò)改進(jìn)模型,可以發(fā)現(xiàn),HOAc也在一定程度上可以起到調(diào)節(jié)作用并使細(xì)胞達(dá)到同步。而后,在HOAc作為同步劑的條件下,同步與非同步的區(qū)域可以由k和kAcE,f在相圖中加以描述。另外,若某一細(xì)胞中的代謝物質(zhì)的初始濃度相對(duì)于其它細(xì)胞較高時(shí),相應(yīng)代謝物的變
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