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文檔簡介
1、計算機輔助藥物設(shè)計在新藥的研究與發(fā)現(xiàn)過程中起著不可忽視的作用,它不僅加快了藥物的研究與開發(fā)的速度,也節(jié)省了大量資金,已經(jīng)成為藥物開發(fā)過程中的一種重要手段。全文共分四章,具體內(nèi)容概括如下: 第一章概述計算機輔助藥物設(shè)計的理論基礎(chǔ)及本文研究對象的文獻(xiàn)背景。 第二章在現(xiàn)代化學(xué)信息學(xué)和生物信息學(xué)的基礎(chǔ)上,以現(xiàn)有的治療老年癡呆癥的藥物GTS-2l為模板分子,在中藥化學(xué)數(shù)據(jù)庫中尋找新的老年癡呆癥的候選藥物。計算采用相似性搜索,柔性疊
2、合以及分子對接方法,得到一個與α7受體結(jié)合較好的分子Mo17235及二者的合理復(fù)合物結(jié)構(gòu),并進(jìn)一步分析Mol7235與(α7 N-膽堿受體的詳細(xì)作用情況。這些信息將有助于設(shè)計出效果更好的治療老年癡呆癥的藥物。 第三章采用乙酰膽堿酯酶與石杉堿甲的復(fù)合物的品體結(jié)構(gòu)((PDB code:lvot),利用相似性搜索和分子對接技術(shù),從中藥數(shù)據(jù)庫中篩選出分子Mol3935,得到乙酰膽堿酯酶與Mo13935的最佳復(fù)合物結(jié)構(gòu)。根據(jù)以上信息,并在
3、一定的理論指導(dǎo)下,對Mo13935進(jìn)行一系列的合理設(shè)計,并得到了較好的設(shè)計方案。通過計算結(jié)果,分析該中藥分子的改造規(guī)律。以上信息將有助于設(shè)計新的或優(yōu)化已有的治療老年癡呆癥的乙酰膽堿酯酶抑制劑。 第四章基于量子化學(xué)和分子力學(xué)原理,分別對同一組最為常見神經(jīng)氨酸酶抑制劑---環(huán)己烯.類神經(jīng)氨酸酶抑制劑進(jìn)行2D-QSAR和3D-QSAR研究,得到了三個2D-QSAR(其中一個最好)模型和一個3D-QSAR模型,結(jié)果表明2D-QSAR模型
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