應(yīng)用SELDI-TOF-MS技術(shù)在賁門癌診斷中的初步研究.pdf

1、目的:賁門癌(Gastric cardia adenocarcinoma,GCA)是我國太行山一帶農(nóng)村高發(fā)的消化道惡性腫瘤,其發(fā)病率在胃癌、食道癌等癌種受到人們重視并得到一定控制時(shí)卻又有升高的趨勢(shì)。由于其特殊的發(fā)病部位和生物學(xué)行為使得患者難以被早期發(fā)現(xiàn),早期診斷,往往在發(fā)現(xiàn)時(shí)便失去有效的治療機(jī)會(huì),治療后五年生存率低。因此,早期診斷對(duì)其治療和預(yù)后有重要意義。近些年,蛋白組學(xué)成為對(duì)疾病特別是腫瘤研究的重點(diǎn)。有關(guān)蛋白組學(xué)的研究方法中,表面增強(qiáng)

2、激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass,SELDI-TOF-MS)在腫瘤標(biāo)志物檢測(cè)等方面顯示出了操作簡單,取材方便,高效高通量等明顯優(yōu)勢(shì)。本研究嘗試?yán)肧ELDI-TOF-MS技術(shù),檢測(cè)并對(duì)比賁門癌患者及正常人的血清蛋白指紋圖譜,建立賁門癌診斷決策樹,并篩檢能夠提示賁門癌淋巴轉(zhuǎn)移的相關(guān)蛋白,為臨床早期診斷賁門癌及判斷預(yù)

3、后提供新的手段和方法。
　　方法:臨床采集101例賁門癌及118例健康人血清分別作為試驗(yàn)組和對(duì)照組,采用SELDI-TOF-MS結(jié)合CM10弱陽離子蛋白交換芯片檢測(cè)各組血清,用biomarker wizard(BMW)軟件對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析,得到試驗(yàn)組和對(duì)照組間的有效差異蛋白峰,通過Biomarker Patterns Software(BPS)從中篩取四個(gè)蛋白峰建立賁門癌診斷決策樹,并對(duì)隨機(jī)選取的樣本用盲法驗(yàn)證決策樹的敏感性和特異性

4、。進(jìn)一步分析對(duì)比有淋巴轉(zhuǎn)移和無淋巴轉(zhuǎn)移的賁門癌患者血清的蛋白指紋圖譜得到差異蛋白,分析其受試者工作特征曲線(receiver operative characteristic curves,ROC曲線)并驗(yàn)證其診斷效能。
　　結(jié)果:BMW軟件分析對(duì)比出賁門癌患者試驗(yàn)組和健康人對(duì)照組血清,共有56個(gè)蛋白表達(dá)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),其中質(zhì)荷比M/Z為5480.49的蛋白峰差異最具顯著性。BPS軟件以質(zhì)荷比M/Z5480.49

5、的差異蛋白為主要根節(jié)點(diǎn),聯(lián)合另外幾個(gè)質(zhì)荷比M/Z分別為7773.55,2858.63,2924.03等幾個(gè)差異蛋白建立診斷分類樹模型,其敏感性為95.05％(96/101),特異性為95.76%(113/118)。檢測(cè)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和未轉(zhuǎn)移患者的血清,其中11個(gè)差異蛋白有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),ROC曲線表明,質(zhì)荷比M/Z3820.87的蛋白峰可提示賁門癌患者有無淋巴轉(zhuǎn)移,其敏感性為84.4%(38/45),特異性為82.1%(46/5