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文檔簡介
1、目的:多種腫瘤細胞中線粒體D-環(huán)已成為多態(tài)性研究熱點,但與惡性淋巴瘤的相關(guān)研究卻很少。本實驗通過研究線粒體D-環(huán)(D-loop區(qū))單核苷酸多態(tài)性(SNPs),探究其與非霍奇金淋巴瘤的患病風(fēng)險及預(yù)后的相關(guān)性。
方法:
1收集2001年1月和2004年1月之間在河北醫(yī)科大學(xué)省四院血液內(nèi)科接受治療的河北省內(nèi)133名漢族NHL患者血液樣本,同時也收集了河北省內(nèi)159名漢族健康人的血液樣本作為對照。所有病人臨床資料相對完善。<
2、br> 2應(yīng)用GENMED全血線粒體DNA萃取試劑盒提取非霍奇金淋巴瘤患者及健康人的線粒體DNA,提取后將其置于-80℃恒溫冰箱中保存?zhèn)溆谩?br> 3 PCR擴增線粒體D-loop區(qū)目的基因,上游引物為5'-CCCCATGCTTACAAGCAAGT-3'(核苷酸16190-16209位點),下游引物為5'-GCTTTGAGGAGGTAAGCTAC-3'(核苷酸602-583位點),擴增的目的片段長度為982-bp,PCR的具體參數(shù)
3、參照PCR預(yù)混試劑盒說明,將PCR產(chǎn)物純化測序,測序使用美國ABIPRISM Genetic Analyzer3100序列分析儀,同一標本采用雙向重復(fù)測序,隨后檢測血標本線粒體DNAD-loop區(qū)單核苷酸多態(tài)性。
4通過電話對患者進行隨訪,計算其10年生存率,同時分析與患者臨床特征的關(guān)系。參照基因數(shù)據(jù)庫AC_000021號數(shù)據(jù),從已經(jīng)完成的NHL患者線粒體D-Loop區(qū)的982bp序列中找出單核苷酸多態(tài)性位點,對不同SNPs位
4、點與患者10年生存率的關(guān)系進行分析。
5統(tǒng)計分析:應(yīng)用x2檢驗對SNP位點顯示頻率進行分析;采用KaPlan-Meier法繪制出生存曲線,應(yīng)用Log-Rank檢驗進行組間比較;使用COX比例風(fēng)險回歸模型分析進行多因素生存分析,并以相對危險度和95%可信區(qū)間(95%CI)來表示。所有數(shù)據(jù)結(jié)果應(yīng)用SPSS18.0統(tǒng)計軟件進行分析,P<0.05,認為差別具有統(tǒng)計學(xué)意義。
結(jié)果:
1在隨訪的133例患者中(54例彌
5、漫型大B細胞淋巴瘤、41例T細胞淋巴瘤、38個其他類型的非霍奇金淋巴瘤),共計91位非霍奇金淋巴瘤患者具有10年隨訪數(shù)據(jù),其中32個診斷為DLBCL,33個TCL和26個其他類型的非霍奇金淋巴瘤。
2在NHL組和對照組的長為982bp線粒體D環(huán)區(qū)中共發(fā)現(xiàn)140個單核苷酸多態(tài)性位點,其中有26個SNPs,其等位基因頻率>5%,可用來分析罹患腫瘤風(fēng)險。
3應(yīng)用x2檢驗在對單個SNPs進行分析時,在NHL患者中發(fā)現(xiàn)73A/
6、G,263A/G和315C/Cinsert這三個多態(tài)性位點P值均<0.05,差別有統(tǒng)計學(xué)意義。200A/G多態(tài)位點在彌漫大B細胞淋巴瘤患者中的P值<0.05,差別有統(tǒng)計學(xué)意義。16362C/T和249Del/AP值均<0.05,差別有統(tǒng)計學(xué)意義。
4對不同的性別及年齡(以60歲為界)NHL患者的10年生存率進行比較,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);對不同的疾病分期及IPI評分NHL患者的10年生存率進行比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意
7、義(P<0.05)。
5根據(jù)所找出的26個SNPs位點,繪制生存曲線,通過Log-Rank檢驗,發(fā)現(xiàn)146C/T、309Cinsert/C、315Cinsert/C、199C/T、16304C/T多肽位點與NHL的生存期有關(guān)。通過COX比例風(fēng)險回歸模型分析這些核苷酸位點及臨床特征與NHL患者10年生存率的關(guān)系,結(jié)果發(fā)現(xiàn)16304C/T位點是NHL患者的預(yù)后獨立預(yù)測因子,基型為16304C的非霍奇金淋巴瘤患者的生存長度明顯短于基
8、因型為16304T的患者(OR0.513;95%CI0.266-0.989; P=0.046)。
結(jié)論:
1線粒體DNAD-loop區(qū)是一個高度多態(tài)性區(qū)域。
273A/G、263A/G、315C/Cinsert多態(tài)位點與非霍奇金淋巴瘤的患病風(fēng)險相關(guān),攜帶73G、263G、315Cinsert等位基因可增加患非霍奇金淋巴瘤的風(fēng)險。
3200A/G多肽位點特別與彌漫大B細胞淋巴瘤風(fēng)險相關(guān),攜帶200G
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