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文檔簡介
1、DNA分子標(biāo)記技術(shù)是基于DNA技術(shù)的分子標(biāo)記體系,可以反映生物個體或種群之間的差異性DNA片段,相對于傳統(tǒng)的形態(tài)標(biāo)記和生化標(biāo)記具有穩(wěn)定、精確、簡便等優(yōu)點?;赟SR技術(shù)的ISSR分子標(biāo)記技術(shù)是其中應(yīng)用最為廣泛的一種,已被廣泛應(yīng)用于食藥用菌的遺傳多樣性、菌株鑒別等方面的研究。
“桑黃”是中國一類傳統(tǒng)藥用真菌,具有抗腫瘤、抗氧化、增強免疫力等多種藥用價值。但該類群中,被認為藥效最佳、真正“桑黃”的桑黃纖孔菌(Inonotus sa
2、nghaung)與其它類群的桑黃從子實體上區(qū)分較為困難,導(dǎo)致“桑黃”名稱混亂現(xiàn)象嚴重,制約了“桑黃”產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展。中國黑木耳(Auricularia heimuer F.Wu,B.K.Cui&Y.C.Dai)人工栽培已有二千多年的歷史,同株異名、同名異株、菌種退化現(xiàn)象嚴重制約黑木耳生產(chǎn)的可持續(xù)性,優(yōu)良品種的選育迫在眉睫。開展桑黃栽培品種、黑木耳主要栽培品種及黑木耳孢子單核體的遺傳多樣性分析,掌握不同栽培菌株鑒別方法,對明確桑黃栽培菌株
3、的類群,充分保護桑黃、黑木耳種質(zhì)資源、開展黑木耳良種選育具有重大意義。
本研究收集5個桑黃栽培品種,1個桑黃野生品種,應(yīng)用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)結(jié)合ITS分子標(biāo)記技術(shù)進行菌株鑒定及遺傳分析;收集34個黑木耳栽培品種及5個黑木耳品種的共計100個孢子單核體,應(yīng)用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)進行遺傳多樣性分析。主要研究結(jié)果如下:
1、確定了適用于桑黃物種的ISSR分析最佳PCR條件:20μL體系中含有1U DNA聚合酶、0.5μm
4、ol/L引物,0.15mmol/L dNTPs、50ng DNA模板。比理論Tm值略高的退火溫度,35個循環(huán)。
2、篩選出了12條對桑黃基因組擴增穩(wěn)定、多態(tài)性較好的引物,共擴增出194條帶。根據(jù)擴增條帶計算遺傳相似性系數(shù)并構(gòu)建聚類圖,桑2、桑4、桑5聚在一起,桑1、桑3單獨聚在一起,表明桑2、桑4、桑5的遺傳相似性較高。從194條帶中選擇29個最佳條帶構(gòu)建5個桑黃栽培菌株的分子身份證。
3、對6個桑黃菌株的rDNA
5、ITS序列進行分析,通過BLAST比對,得到最似物種名,桑1為Inonotus linteus,桑2、桑4、桑5為Inonotus vaninii,桑3為Inonotus obliquus,桑6為Inonotu sanghaung,并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。ITS分子標(biāo)記結(jié)果與ISSR分子標(biāo)記結(jié)果一致,證明兩者相結(jié)合可對菌株進行鑒定,結(jié)果準(zhǔn)確可靠。
4、篩選出10條引物,對34個黑木耳菌株的基因組進行擴增,共擴增出167條帶,根據(jù)擴增
6、條帶計算GS值,并構(gòu)建聚類圖。結(jié)果顯示在0.64的相似水平上,34個菌株可分為5類,并不完全按照地區(qū)分類,東北的6個菌株聚在一起;其中黑金、黑圓可認為是同一菌株。該結(jié)果說明南北兩個栽培地區(qū)菌種交流頻繁,東北地區(qū)栽培菌株遺傳背景較為單一;同株異名現(xiàn)象的存在。
5、34個黑木耳栽培菌株的Nei's基因多樣性指數(shù)(h)為0.2865,Shannon信息指數(shù)(I)為0.4420,菌株基因流(Nm)值較大,為2.0850,說明該34個菌
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