杉木莖段皮層基因表達(dá)分析.pdf

1、利用差異顯示法(DDRT-PCR)研究杉木的2個(gè)自然變異類型(旬容0號及獨(dú)干杉)皮層(包含周皮、韌皮部、形成層及初生木質(zhì)部)基因表達(dá)差異，共獲得29個(gè)差異片段，測序后進(jìn)行Blast比對分析。結(jié)果表明： 1)Blastn比對(分值＞60)分析表明共有9個(gè)片段在GeneBank中找到了相似的功能。分別與核糖體蛋白基因、信號傳導(dǎo)功能、泛素蛋白基因、抗性功能、組氨酸磷酸轉(zhuǎn)移蛋白、細(xì)胞發(fā)生功能及能量代謝相關(guān)。 2)Blastx比對

2、分析有12個(gè)序列可進(jìn)行功能推測。其中7個(gè)片段和細(xì)菌、動(dòng)物的功能相似，涉及膜結(jié)構(gòu)、細(xì)胞因子、代謝過程中酶的活性及一些未知蛋白。 3)還有8個(gè)差異片段在數(shù)據(jù)庫中未發(fā)現(xiàn)匹配信息。 對句容0號杉莖段皮層cDNA文庫隨機(jī)測序。分析表明有效EST序列1，119條，聚類分析和拼接后獲得354個(gè)UniGenes。Unigene比對結(jié)果表明： 1)高度相似和中度相似的序列分別為58個(gè)和70個(gè)，低度相似和無匹配序列合計(jì)達(dá)63.8％。