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文檔簡介
1、目的:應用懲罰logistic回歸模型(Penalized logistic regression,PLR)解決傳統(tǒng)logistic回歸不能分析高階交互作用的問題,并將PLR與現(xiàn)階段國外廣泛用于分析基因—基因、基因—環(huán)境交互作用的多因子降維法(Multifactor dimensionality reduction,MDR)進行對比分析,闡明二者在完成交互作用分析時各自的優(yōu)劣勢及其適用條件,為復雜的生物醫(yī)學現(xiàn)象交互作用解釋與分析提供合理
2、的方法學依據(jù)。 方法:介紹MDR分析原理及MDR交互作用分析技術。介紹懲罰logistic回歸模型與原理。針對傳統(tǒng)Logistic回歸參數(shù)估計中遇到的樣本含量問題,檢測低階、高階交互作用能力問題等進行模擬研究,全部過程在R軟件中編程實現(xiàn)。結合實例應用,進一步對比研究PLR、MDR解決醫(yī)學應用問題,闡明其適用條件以及不同方法分析交互作用的優(yōu)勢。 結果:模擬研究與實例分析表明,不同的調(diào)整參數(shù)λ對懲罰logistic回歸模型的
3、分析結果會產(chǎn)生較大的影響;調(diào)整參數(shù)λ使得統(tǒng)計量C得分最小的模型偏差最小,得到的估計系數(shù)相對較穩(wěn)定,是推薦采納的最佳模型。經(jīng)PLR與LR的對比模擬研究,認為PLR偏差更小,得到的模型更穩(wěn)定。尤其在樣本量低于200時,懲罰Logistic回歸模型顯示出了更多的優(yōu)勢。交互作用檢測能力模擬研究顯示,在低維交互作用檢測中,懲罰Logistic回歸表現(xiàn)出MDR無可比擬的優(yōu)越性。在高維或高階交互作用檢測時,MDR和PLR檢測交互作用的能力相近,均能靈
4、敏地檢測出交互作用。即使加入干擾項后,也不會降低其檢測交互作用的能力。MDR對高階交互作用較敏感,能夠檢測出各種類型的交互作用,而懲罰Logistic回歸更適合于相乘模型的交互作用分析。 結論:懲罰Logistic回歸、MDR與其他方法相比,更能有效得檢測出多因素交互作用的存在。本文經(jīng)過模擬研究與實例分析得出如下結論:(1)當樣本含量較小時傳統(tǒng)Logistic回歸估計結果欠穩(wěn)定;樣本量低于200時,懲罰Logistic回歸更具優(yōu)
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