擬南芥及水稻中miRNA基因家族的擴增方式及表達特征研究.pdf

1、本文對目前己知的擬南芥和水稻中的miRNA進行分析表明，接近50％的miRNA是由基因組中的多個位置編碼產(chǎn)生的。利用生物信息學(xué)方法我們分析了擬南芥及水稻中多拷貝的miRNA基因家族成員可能的擴增途徑，發(fā)現(xiàn)擬南芥中37％的miRNA基因和水稻中35％的miRNA基因之間存在基因復(fù)制的現(xiàn)象，我們認為miRNA基因家族與許多編碼蛋白的基因家族，如轉(zhuǎn)錄因子基因家族成員的擴增方式相似，兩者均利用了染色體中大片斷復(fù)制的方式使得家族中的成員數(shù)量得以擴

2、增。為了分析這些miRNA基因家族中各基因的表達情況，我們利用RT-PCR的方法研究了水稻和擬南芥中共10個miRNA基因家族中的48個miRNA基因家族各個成員的表達情況，發(fā)現(xiàn)同一基因家族中的不同成員表達模式存在著差異，說明在進化過程中，這些不同成員的表達調(diào)控機制已經(jīng)出現(xiàn)了分化。此外，盡管miR160和miR162的序列在水稻和擬南芥中均比較保守，但這兩個基因家族的成員分別在水稻和擬南芥中表達特征卻并不相同，可能在水稻和擬南芥中對這兩

3、個基因家族的表達存在不同的調(diào)控機制。在對表達特征存在差異的擬南芥中miR168家族中的兩個基因At-MIR168a和At-MIR168b進行功能分析時發(fā)現(xiàn)，這兩個基因均可以產(chǎn)生miR168，并調(diào)節(jié)其靶基因Agronaute1，說明這兩個基因還未發(fā)生功能的分化而產(chǎn)生不同的miRNA。在對這兩個基因啟動子活性分析時發(fā)現(xiàn)，轉(zhuǎn)錄水平的差異是造成這種表達模式差異的重要原因。對At-MIR168a啟動子中可能在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中起作用的順式作用元件的初步分